所以，這時共產國際討論馬林的黨內合作方針時，馬林還沒有說服國共雙方同意。再加上當時共產國際執行的是莫斯科的「聯吳疏孫」的方針，當然不可能做出明確的決定國共合作的決議和指示，隻能靜觀事態的發展和馬林回中國後的工作，以使莫斯科保持進退自如的主動權。
莫斯科這種態度在馬林回中國後利用陳炯明叛孫、逼迫孫聯俄聯共，又以共產國際的權威逼迫中共加入國民黨之後，還沒有轉過彎來。以至於在1922年11月召開共產國際四大時，拉狄克在發言中，當著陳獨秀等中國代表的麵，竟然還說出要共產黨聯吳的話來：
當吳佩孚同張作霖打仗時，他有長江一線和那裏的兵工廠作後盾，但他沒有掌握北方的鐵路，控製鐵路的人被日本人收買了。他是怎麽辦的呢？他向年輕的共產黨尋求支持，共產黨派了一些黨代表給他。在戰爭期間，黨代表牢牢掌握了鐵路，供在那兒進行革命鬥爭的吳佩孚軍隊使用。在中國誰進行反對日本帝國主義的鬥爭，誰就是為中國革命的發展而鬥爭……後來，工人向吳佩孚提出了自己的要求，也使這些要求部分地得到了實現。由於這樣的支持，由於革命的資產階級力量實現了自己的使命，我們的同誌在華北的工人群眾中站住腳。[40]
把吳佩孚視為「革命的資產階級」，把反日視為革命與反革命的標準，這是多麽錯誤的觀念和荒唐的邏輯。
就這樣，馬林對莫斯科的「聯吳疏孫」方針憋著一股氣，同時，又以那樣的身份和「全副武裝」，於8月中旬來到上海，一麵命令共產黨執行加入國民黨的決定，一麵做國民黨的工作。為此，他與國共兩黨領導人頻繁接觸，還把李大釗調到上海，幫助工作。因為李對孫中山和陳獨秀都有較大影響。這時，孫中山因受到陳炯明背叛的沉重打擊，處於「光杆司令」的極度困難和絕望的精神狀態中，所以，非常歡迎共產黨和青年團這批「新鮮血液」的輸入，以挽救國民黨。這也就是他非要共產黨人加入國民黨、隻同意黨內合作的根本原因。但共產黨內，除了李大釗等個別人之外，陳獨秀等絕大多數還是抵製共產國際的方針。
於是，8月28～30日，在馬林的要求下，中共中央在杭州召開特別會議，討論共產國際的決定。會上，由於陳獨秀等多數中央委員繼續反對馬林的意見，發生激烈爭論。馬林說國民黨不是「資產階級的政黨」，而是一個「各階層革命分子的聯盟」。陳獨秀反對，強調「國民黨主要是一個資產階級的政黨」，共產黨員加入國民黨，「會引起許多複雜而不易解決的問題，其結果將有害於革命勢力的團結」，「混合了階級組織和牽製了我們的獨立政策」。最後，馬林隻得拿出「尚方寶劍」，說這是共產國際的決定，不同意也得服從。陳獨秀無奈地表示：「如果這是共產國際的不可改變的決定，我們應當服從。」但他提出的條件是：孫中山必須取消按手模宣誓服從他等封建獨裁的入黨辦法，並根據民主主義原則改組國民黨。關於這一點，馬林在7月給共產國際的報告中也認為是國民黨的缺點，所以是支持陳獨秀的。李大釗也表示支持。但張國燾、蔡和森仍反對共產國際的決定。會議表決，最後以多數通過了陳獨秀的意見，但沒有形成文字決議，提供給中共三大做出決定。
如上分析，當時共產國際並沒有正式做出令共產黨加入國民黨的決議。但是，馬林卻充分引用共產國際給他的權力，壓服了中共中央。陳獨秀是一個言而有信、光明磊落的人，既然服從，就決不搞陽奉陰違的小動作。於是，我們看到他在思想上仍有保留的情況下，行動上卻表現出極大的熱情，積極貫徹共產國際的指示，密切配合馬林的行動。
杭州會議一結束，陳獨秀即與馬林、李大釗一起去拜訪了孫中山。孫聽取陳獨秀等人關於改組國民黨的意見，在9月4日召集了國民黨各省市50餘名負責人開會，討論改組問題。會後，在孫中山同意改組並取消入黨時按手模宣誓效忠於他的情況下，陳獨秀、蔡和森、張太雷由張繼介紹，孫中山主盟加入了國民黨。6日，陳獨秀等9名國民黨骨幹即被孫中山指定組成國民黨政務改進起草委員會。1923年1月21日，孫中山又任命陳獨秀、廖仲愷等21人為國民黨本部參議。4月10日，孫中山又以中華民國陸海軍大元帥的名義，發布命令，委任陳獨秀為大本營宣傳委員會委員，與馬林共同製訂改組國民黨的計劃。孫中山與其他領導人討論這一計劃後，委託陳獨秀修改，製訂出一個更詳細的計劃，最後為孫中山所接受，開始改組工作。
與此同時，陳獨秀還發揮其宣傳、教育方麵的特長，對國共兩黨內對黨內合作方針尚有疑慮或激烈反對的黨員做工作，在多家刊物上發表闡述國共合作必要性和迫切性的文章，造成一種重大的輿論影響。
例如，他一接受國共合作方針，就在國民黨中央機關報上發表重要文章，宣傳國民黨的革命性，號召大家都來加入國民黨。他認為中國現在政治狀況的特點之一是「政黨之萎弱」。由於這月中旬剛剛被捕後保釋，為了對付反動派的耳目，他故意寫道：「幼稚的中國無產階級，眼前還沒有代表他的政黨出現」，意在說明共產黨還「很萎弱」；而「代表資產階級的政黨也很萎弱。這就是中國資產階級還沒有強壯的表徵。孤軍奮鬥的國民黨，我們極尊重他有民主革命的歷史，現在他還本著民主革命的精神進行，但黨員尚少，運用政黨政治來代替軍閥的力量還嫌不足」，因此要傾覆封建軍閥，反抗國際帝國主義，「隻有集中全國民主主義的分子組織強大的政黨」。[41]
莫斯科這種態度在馬林回中國後利用陳炯明叛孫、逼迫孫聯俄聯共，又以共產國際的權威逼迫中共加入國民黨之後，還沒有轉過彎來。以至於在1922年11月召開共產國際四大時，拉狄克在發言中，當著陳獨秀等中國代表的麵，竟然還說出要共產黨聯吳的話來：
當吳佩孚同張作霖打仗時，他有長江一線和那裏的兵工廠作後盾，但他沒有掌握北方的鐵路，控製鐵路的人被日本人收買了。他是怎麽辦的呢？他向年輕的共產黨尋求支持，共產黨派了一些黨代表給他。在戰爭期間，黨代表牢牢掌握了鐵路，供在那兒進行革命鬥爭的吳佩孚軍隊使用。在中國誰進行反對日本帝國主義的鬥爭，誰就是為中國革命的發展而鬥爭……後來，工人向吳佩孚提出了自己的要求，也使這些要求部分地得到了實現。由於這樣的支持，由於革命的資產階級力量實現了自己的使命，我們的同誌在華北的工人群眾中站住腳。[40]
把吳佩孚視為「革命的資產階級」，把反日視為革命與反革命的標準，這是多麽錯誤的觀念和荒唐的邏輯。
就這樣，馬林對莫斯科的「聯吳疏孫」方針憋著一股氣，同時，又以那樣的身份和「全副武裝」，於8月中旬來到上海，一麵命令共產黨執行加入國民黨的決定，一麵做國民黨的工作。為此，他與國共兩黨領導人頻繁接觸，還把李大釗調到上海，幫助工作。因為李對孫中山和陳獨秀都有較大影響。這時，孫中山因受到陳炯明背叛的沉重打擊，處於「光杆司令」的極度困難和絕望的精神狀態中，所以，非常歡迎共產黨和青年團這批「新鮮血液」的輸入，以挽救國民黨。這也就是他非要共產黨人加入國民黨、隻同意黨內合作的根本原因。但共產黨內，除了李大釗等個別人之外，陳獨秀等絕大多數還是抵製共產國際的方針。
於是，8月28～30日，在馬林的要求下，中共中央在杭州召開特別會議，討論共產國際的決定。會上，由於陳獨秀等多數中央委員繼續反對馬林的意見，發生激烈爭論。馬林說國民黨不是「資產階級的政黨」，而是一個「各階層革命分子的聯盟」。陳獨秀反對，強調「國民黨主要是一個資產階級的政黨」，共產黨員加入國民黨，「會引起許多複雜而不易解決的問題，其結果將有害於革命勢力的團結」，「混合了階級組織和牽製了我們的獨立政策」。最後，馬林隻得拿出「尚方寶劍」，說這是共產國際的決定，不同意也得服從。陳獨秀無奈地表示：「如果這是共產國際的不可改變的決定，我們應當服從。」但他提出的條件是：孫中山必須取消按手模宣誓服從他等封建獨裁的入黨辦法，並根據民主主義原則改組國民黨。關於這一點，馬林在7月給共產國際的報告中也認為是國民黨的缺點，所以是支持陳獨秀的。李大釗也表示支持。但張國燾、蔡和森仍反對共產國際的決定。會議表決，最後以多數通過了陳獨秀的意見，但沒有形成文字決議，提供給中共三大做出決定。
如上分析，當時共產國際並沒有正式做出令共產黨加入國民黨的決議。但是，馬林卻充分引用共產國際給他的權力，壓服了中共中央。陳獨秀是一個言而有信、光明磊落的人，既然服從，就決不搞陽奉陰違的小動作。於是，我們看到他在思想上仍有保留的情況下，行動上卻表現出極大的熱情，積極貫徹共產國際的指示，密切配合馬林的行動。
杭州會議一結束，陳獨秀即與馬林、李大釗一起去拜訪了孫中山。孫聽取陳獨秀等人關於改組國民黨的意見，在9月4日召集了國民黨各省市50餘名負責人開會，討論改組問題。會後，在孫中山同意改組並取消入黨時按手模宣誓效忠於他的情況下，陳獨秀、蔡和森、張太雷由張繼介紹，孫中山主盟加入了國民黨。6日，陳獨秀等9名國民黨骨幹即被孫中山指定組成國民黨政務改進起草委員會。1923年1月21日，孫中山又任命陳獨秀、廖仲愷等21人為國民黨本部參議。4月10日，孫中山又以中華民國陸海軍大元帥的名義，發布命令，委任陳獨秀為大本營宣傳委員會委員，與馬林共同製訂改組國民黨的計劃。孫中山與其他領導人討論這一計劃後，委託陳獨秀修改，製訂出一個更詳細的計劃，最後為孫中山所接受，開始改組工作。
與此同時，陳獨秀還發揮其宣傳、教育方麵的特長，對國共兩黨內對黨內合作方針尚有疑慮或激烈反對的黨員做工作，在多家刊物上發表闡述國共合作必要性和迫切性的文章，造成一種重大的輿論影響。
例如，他一接受國共合作方針，就在國民黨中央機關報上發表重要文章，宣傳國民黨的革命性，號召大家都來加入國民黨。他認為中國現在政治狀況的特點之一是「政黨之萎弱」。由於這月中旬剛剛被捕後保釋，為了對付反動派的耳目，他故意寫道：「幼稚的中國無產階級，眼前還沒有代表他的政黨出現」，意在說明共產黨還「很萎弱」；而「代表資產階級的政黨也很萎弱。這就是中國資產階級還沒有強壯的表徵。孤軍奮鬥的國民黨，我們極尊重他有民主革命的歷史，現在他還本著民主革命的精神進行，但黨員尚少，運用政黨政治來代替軍閥的力量還嫌不足」，因此要傾覆封建軍閥，反抗國際帝國主義，「隻有集中全國民主主義的分子組織強大的政黨」。[41]