此後，台灣也出版了幾本關注蔡元培教育思想的專著，如孫德中的《蔡元培教育學說》[54]，是第一本研究蔡氏教育理論的專書；孫常煒的《蔡元培先生的生平及其教育思想》[55]，附有《蔡孑民先生傳略》，內容除討論蔡元培的事跡、學問、人格和信仰之外，也偏重教育方麵的說明；陶英惠編著的《蔡元培年譜》[56]，具開創之功，可惜隻編到1916年，下冊一直未能出版。英文方麵，1977年美國學者戴維翰（william j. duiker）所著的《蔡元培：現代中國的教育家》（ts』ai yuan-p』ei：educator of modern china）出版（pennsylvania state university press，1977），這本概說式的傳記，是目力所及的外文中最早的蔡元培研究專著。
1980年至2000年前後，是蔡元培研究的高產期，也是湧現出大批高質量的研究作品的時段。自1979年起，早年即受蔡氏囑託編輯著述的高平叔，在蔡元培家屬的支持下，又開始著手蔡元培文集的整理工作，並於1984年到1988年間由中華書局出版了七卷本的《蔡元培全集》，收錄了蔡元培撰寫的專書、論文、小說、序跋、演講詞、談話錄、書信、電文、宣言、譯文等，為蔡元培研究奠定了堅實的基礎。[57]1984年出版的周天度撰寫的《蔡元培傳》，詳細梳理了蔡氏一生的言論活動，因當時《蔡元培全集》尚未結集，該書多直接引用第一手資料，既使用了當時並未結集出版的蔡元培手稿，又頗注意搜羅報紙雜誌上的有關報導，是為蔡元培研究的必讀之書。作者充分肯定了蔡元培對北大改革的貢獻，認為其「是在高等教育領域內發動的一場革命，是教育製度、教育思想以及學術思想的一場破舊立新的革命」。[58]樑柱的《蔡元培與北京大學》是第一部專門探討蔡元培與北大關係的著作。作者敘述了蔡氏在北大銳意改革和整頓學校、廣延積學與熱心的教員、推動學製改革與課程建設等的情形，對他開創學術研究和思想、自由的風氣，在新舊思潮的激烈衝突中奮起應戰，以及反對軍閥政府摧殘教育等方麵也有相當多的討論。[59]2006年，樑柱又出版了《蔡元培教育思想論析》一書，專論蔡氏教育思想。[60]
進入1990年代之後，借《蔡元培全集》（七卷本）出版之東風，蔡元培研究又進入高產期。1993年張曉唯的《蔡元培評傳》，被收入百花洲文藝出版社的「國學大師叢書」。[61]全書除了敘述蔡氏的學術生涯、生平行誼、為學風範、待人接物的態度以及教育事業外，還著重說明蔡氏的學術貢獻，對其著述做了概括介紹，是為此書的一大特色。[62]此外，作者還撰寫了《蔡元培與胡適（1917～1937）——中國文化人與自由主義》一書，論述了蔡元培、胡適二人的交誼、文化思想的異同、教育獨立之夢、紅學之爭、政治情結、人際交遊與做人風範，透過對比二人的立身行事，更多關注微觀上心態的發展與變化。[63]
1994年出版的金林祥的《蔡元培教育思想研究》，是遼寧教育出版社「中國近現代教育家係列研究」叢書之一種。[64]該書在全麵回顧蔡元培生平的基礎上，分別以專題形式探討了蔡元培在大學教育、社會教育、女子教育、德育、美育等方麵的活動及主張。2004年，作者又以蔡元培的大學教育為中心，係統討論了蔡元培對北京大學進行改革的思想與實踐。[65]
蔡建國的《蔡元培與近代中國》分為上、下兩篇。上篇側重討論蔡元培早期經歷，探討了蔡氏如何從士大夫轉型為新式的知識分子，如何走上反清的革命道路，如何受到日本、德國、法國文化的影響，以及如何開展留法勤工儉學的運動等課題；下篇主要從思想文化層麵分析蔡元培與近代中國思想學術界的關係及其意義。此書把蔡元培放在近代中國歷史的發展進程中，以專題形式做出研究，從橫向和縱向的角度著墨，實為用功之作。[66]早在1984年，作者便編寫了《蔡元培先生紀念集》，搜集、整理了散落在當時各大報紙上的紀念性文章，對當時剛剛展開的蔡元培研究多有助力。[67]
1996年，高平叔先生在1980年《蔡元培年譜》（簡編）的基礎上撰著而成的三冊《蔡元培年譜長編》（共四本）由人民教育出版社出版。該年譜共200餘萬字，史料翔實，考辨嚴謹，是近代名人年譜代表作品。書前有高平叔先生之自序，記載了從六十年前受蔡元培囑託編寫文集，記錄口述自傳，到1980年之後開始整理蔡元培遺著，編寫年譜等諸多前因後果，也是不可多得的對蔡元培研究史進行詳細梳理的作品。
1997年，為紀念蔡元培誕辰130 周年，中國蔡元培研究會在原有基礎上進一步搜集整理蔡元培的有關資料，由浙江教育出版社出版了18卷本的《蔡元培全集》。與中華書局版的《蔡元培全集》相比，它增加了報刊資料、以前尚未收入的佚文500多篇，還有蔡元培親屬提供的未刊資料，是迄今最為完備的注釋本。[68]1995年台北錦繡出版事業股份有限公司出版《蔡元培文集》，按專題分為14卷。另外，台灣學者孫常煒先生繼其《蔡元培全集》之後編著了《蔡元培先生全集續編》。1999年，浙江教育出版社在《蔡元培全集》的基礎上，出版了《蔡元培書信集》。書信集增加了新發現的信函，共收錄蔡元培信件1671 件，還附錄他人致蔡元培的信函201 件。
以北大百年校慶為契機，陳平原在《讀書》雜誌上連載了有關北大校史的雜說係列，以及發表於其他報章上與北大校慶相關的文章，分別收錄於《老北大的故事》和《北大精神及其他》兩書之中。作者以「大學故事」的方式來講北大歷史，筆調輕快，行文自如，十分引人入勝。陳平原還與夏曉虹合作編輯了《北大舊事》，並與鄭勇選編《追憶蔡元培》等，輯錄了時人對北大及蔡元培的評論、追憶，已經成為研究北大與蔡元培的必讀之書。與之相似的資料還有1998年浙江教育出版社編輯的《蔡元培紀念集》。該書不僅收錄了紀念蔡元培的文章，也收錄了蔡元培研究會成立前後的相關報導，以及蔡元培逝世後《大公報》《中央日報》的相關報導，有一定的史料價值。
1980年至2000年前後，是蔡元培研究的高產期，也是湧現出大批高質量的研究作品的時段。自1979年起，早年即受蔡氏囑託編輯著述的高平叔，在蔡元培家屬的支持下，又開始著手蔡元培文集的整理工作，並於1984年到1988年間由中華書局出版了七卷本的《蔡元培全集》，收錄了蔡元培撰寫的專書、論文、小說、序跋、演講詞、談話錄、書信、電文、宣言、譯文等，為蔡元培研究奠定了堅實的基礎。[57]1984年出版的周天度撰寫的《蔡元培傳》，詳細梳理了蔡氏一生的言論活動，因當時《蔡元培全集》尚未結集，該書多直接引用第一手資料，既使用了當時並未結集出版的蔡元培手稿，又頗注意搜羅報紙雜誌上的有關報導，是為蔡元培研究的必讀之書。作者充分肯定了蔡元培對北大改革的貢獻，認為其「是在高等教育領域內發動的一場革命，是教育製度、教育思想以及學術思想的一場破舊立新的革命」。[58]樑柱的《蔡元培與北京大學》是第一部專門探討蔡元培與北大關係的著作。作者敘述了蔡氏在北大銳意改革和整頓學校、廣延積學與熱心的教員、推動學製改革與課程建設等的情形，對他開創學術研究和思想、自由的風氣，在新舊思潮的激烈衝突中奮起應戰，以及反對軍閥政府摧殘教育等方麵也有相當多的討論。[59]2006年，樑柱又出版了《蔡元培教育思想論析》一書，專論蔡氏教育思想。[60]
進入1990年代之後，借《蔡元培全集》（七卷本）出版之東風，蔡元培研究又進入高產期。1993年張曉唯的《蔡元培評傳》，被收入百花洲文藝出版社的「國學大師叢書」。[61]全書除了敘述蔡氏的學術生涯、生平行誼、為學風範、待人接物的態度以及教育事業外，還著重說明蔡氏的學術貢獻，對其著述做了概括介紹，是為此書的一大特色。[62]此外，作者還撰寫了《蔡元培與胡適（1917～1937）——中國文化人與自由主義》一書，論述了蔡元培、胡適二人的交誼、文化思想的異同、教育獨立之夢、紅學之爭、政治情結、人際交遊與做人風範，透過對比二人的立身行事，更多關注微觀上心態的發展與變化。[63]
1994年出版的金林祥的《蔡元培教育思想研究》，是遼寧教育出版社「中國近現代教育家係列研究」叢書之一種。[64]該書在全麵回顧蔡元培生平的基礎上，分別以專題形式探討了蔡元培在大學教育、社會教育、女子教育、德育、美育等方麵的活動及主張。2004年，作者又以蔡元培的大學教育為中心，係統討論了蔡元培對北京大學進行改革的思想與實踐。[65]
蔡建國的《蔡元培與近代中國》分為上、下兩篇。上篇側重討論蔡元培早期經歷，探討了蔡氏如何從士大夫轉型為新式的知識分子，如何走上反清的革命道路，如何受到日本、德國、法國文化的影響，以及如何開展留法勤工儉學的運動等課題；下篇主要從思想文化層麵分析蔡元培與近代中國思想學術界的關係及其意義。此書把蔡元培放在近代中國歷史的發展進程中，以專題形式做出研究，從橫向和縱向的角度著墨，實為用功之作。[66]早在1984年，作者便編寫了《蔡元培先生紀念集》，搜集、整理了散落在當時各大報紙上的紀念性文章，對當時剛剛展開的蔡元培研究多有助力。[67]
1996年，高平叔先生在1980年《蔡元培年譜》（簡編）的基礎上撰著而成的三冊《蔡元培年譜長編》（共四本）由人民教育出版社出版。該年譜共200餘萬字，史料翔實，考辨嚴謹，是近代名人年譜代表作品。書前有高平叔先生之自序，記載了從六十年前受蔡元培囑託編寫文集，記錄口述自傳，到1980年之後開始整理蔡元培遺著，編寫年譜等諸多前因後果，也是不可多得的對蔡元培研究史進行詳細梳理的作品。
1997年，為紀念蔡元培誕辰130 周年，中國蔡元培研究會在原有基礎上進一步搜集整理蔡元培的有關資料，由浙江教育出版社出版了18卷本的《蔡元培全集》。與中華書局版的《蔡元培全集》相比，它增加了報刊資料、以前尚未收入的佚文500多篇，還有蔡元培親屬提供的未刊資料，是迄今最為完備的注釋本。[68]1995年台北錦繡出版事業股份有限公司出版《蔡元培文集》，按專題分為14卷。另外，台灣學者孫常煒先生繼其《蔡元培全集》之後編著了《蔡元培先生全集續編》。1999年，浙江教育出版社在《蔡元培全集》的基礎上，出版了《蔡元培書信集》。書信集增加了新發現的信函，共收錄蔡元培信件1671 件，還附錄他人致蔡元培的信函201 件。
以北大百年校慶為契機，陳平原在《讀書》雜誌上連載了有關北大校史的雜說係列，以及發表於其他報章上與北大校慶相關的文章，分別收錄於《老北大的故事》和《北大精神及其他》兩書之中。作者以「大學故事」的方式來講北大歷史，筆調輕快，行文自如，十分引人入勝。陳平原還與夏曉虹合作編輯了《北大舊事》，並與鄭勇選編《追憶蔡元培》等，輯錄了時人對北大及蔡元培的評論、追憶，已經成為研究北大與蔡元培的必讀之書。與之相似的資料還有1998年浙江教育出版社編輯的《蔡元培紀念集》。該書不僅收錄了紀念蔡元培的文章，也收錄了蔡元培研究會成立前後的相關報導，以及蔡元培逝世後《大公報》《中央日報》的相關報導，有一定的史料價值。