南京紅卍字會副會長許傳音博士在他的宣誓口述（檢證一七三四。作為法庭證據而被拒絕）中，就發生事態的最嚴重期間的情況這樣說，南京陷落以後，日本兵舉行的“罪惡的宴會”持續了三個月之久，然後逐漸停下來。然而，正如陳瑞芳女士、馬吉牧師、貝茨博士等人所說的那樣，歡慶南京勝利的宴會瘋狂到了極點時，那是在占領後六、七個星期，這似乎是事實。
如上所述，貝茨博士認為，從二月六、七日左右開始，情況有所好轉，可是，在美國駐南京大使館秘書艾利森於二月十八日給當時在漢口的美國大使和國務卿拍電報（檢證一九○六，未在法庭上宣讀）時說：
據報告說，這兩、三天南京情況有顯著好轉，感到高興。大部分中國
人從中國人所謂的“安全區”返回市區各地區他們以前居住的地方。關於
反映日本軍人秩序混亂和不法行為的報告，在數量上有實質性的減少。日
本官憲保證，將努力改善居民的目前生活狀況。
對外僑在行動上的限製逐漸放寬，美國的一所設施——南京大學醫院
需要歸還。
最近同意美籍醫生返回南京（《遠速》 五十九號，載前引資料集1，
第一六三頁）。
整飭軍紀、風紀
在占領後一個半月左右的時間裏，徒有其名的警備兵像野獸一樣，在南京城內為所欲為。警備司令官自不待言，華中方麵軍和上海派遣軍司令部無意也無力去取締軍隊的犯罪行為。中央對這種情況看不下去，到一月底，參謀總長發出“關於整飭軍紀的訓示” （《軍事警察勤務教程》，載續現代史資料4《軍事警察》，第四二八頁），與此同時，特別派遣高級軍官，著手整飭南京占領軍的軍紀、風紀。
關於這段時間的情況，貝茨博士在遠東國際軍事審判法庭上作證說：“據了解，二月五日或六日左右。來了日本軍的高級軍官，把駐屯在南京的部隊軍官，主要是尉級軍官和下士官集中起來，向他們宣布，為了日本軍的土氣和名譽，必須立即停止這種狀態的發展。但當時未曾聽到採取過什麽有效措施，也未曾聽到對犯有強姦和其他暴行的士兵進行過處罰。 ”（《遠速》，三十六號，載前引資料集1，第五十六頁）
如上述貝茨博士在證詞中所說的那樣，從二月六、七日左右開始，情況有所好轉，如果這是事實，那可以認為，這還是當時東京向南京派遣高級軍官去整頓下級軍官和下士官這一事實所取得的直接效果。如果是確實產生這種效果的話. 那末，中央為什麽不及早採取措施呢？對此，至今甚為遺憾。
大本營派遣陸軍高級武官前往南京，慎重宣布要整飭軍紀，這似乎是外務大臣廣田弘毅同陸軍大臣杉山元大將交涉的結果，因為廣田看到了來自外務省派駐南京機構的報告，也接到了美國駐日大使格魯就日本軍侵犯美國財產而提出的抗議。
根據檢察方麵在遠東國際軍事審判時提出的證據（檢證一九○六），格魯在一月三十一日給美國駐南京、北平（北京）、漢口大使館拍發的電報中說：“今天，大使館陸軍武官在陸軍省得到秘密通知，本間大將（旁註原文如此——譯者）作為大本營的代表前往中國，為防止侵犯外國權益的情況發生，已向鬆井大將下達大本營的訓令。”格魯又在二月四日向國務院拍發的電報中報告說：“今晨九時，向外務大臣遞交了正式通知……大臣作了答覆。最重大的訓令由大本營發出，理應告知在華的各司令官。其主要內容是必須停止這些掠奪行為，並派遣本間少將前往南京進行調查，確保命令的執行。”（在檢證一九○六中，這些電報未在法庭上宣讀。僅一月三十一日的電報收錄在前引書1， 第一六三頁中，二月四日的電報是一九○六一六，第五十六至六十一頁）
貝茨博士認為，日本軍的高級軍官來到南京是在二月五、六日左右，但根據美國駐日大使館的電報，本間少將離開日本似乎是在一月三十一日。鬆井大將在接受遠東國際軍事審判時，對向他提出的反問所作陳述是，本間陸軍少將受參謀本部的派遣，於一月下旬前往他在上海的司令部，說是東京當局看到了關於在華日本兵暴行的有關報告， 非常擔憂（《遠速》，三二○號，載前引書1，第二八五頁）。當時就任外務省東亞局局長石射豬太郎也在上述審判時的宣誓供詞中說：“記得是在一九三八年一月底左右，陸軍中央特別派人前往當地的軍隊。後來知道派來的是本間少將。從此以後，南京大屠殺才停止下來”（《遠速》，二八五號，載前引書1，第二二○頁）。參謀本部第二部部長本間雅睛少將到達南京時，恐怕是在二月一日。
參謀本部以總長的名義發出了關於整飭軍紀的訓令，又派遣本間少將前往當地。其結果，日本兵的暴行終算停下來了，而南京市民消除了不安情緒看來是在二月中旬。
還有一個問題，即關於強姦事件。證人許傳音在遠東國際軍事審判法庭上作證說，也有這種情況：“這種野蠻行為逐漸減少，那是由於日華雙方都為不再發生類似問題而進行努力的結果。要說作了哪些努力，那首先是設立供日本兵遊樂的場所，即安慰所， 以使讓妓女在那裏賣淫。”（《遠速》，三十五號，載前引書1，第三十五頁）
如上所述，貝茨博士認為，從二月六、七日左右開始，情況有所好轉，可是，在美國駐南京大使館秘書艾利森於二月十八日給當時在漢口的美國大使和國務卿拍電報（檢證一九○六，未在法庭上宣讀）時說：
據報告說，這兩、三天南京情況有顯著好轉，感到高興。大部分中國
人從中國人所謂的“安全區”返回市區各地區他們以前居住的地方。關於
反映日本軍人秩序混亂和不法行為的報告，在數量上有實質性的減少。日
本官憲保證，將努力改善居民的目前生活狀況。
對外僑在行動上的限製逐漸放寬，美國的一所設施——南京大學醫院
需要歸還。
最近同意美籍醫生返回南京（《遠速》 五十九號，載前引資料集1，
第一六三頁）。
整飭軍紀、風紀
在占領後一個半月左右的時間裏，徒有其名的警備兵像野獸一樣，在南京城內為所欲為。警備司令官自不待言，華中方麵軍和上海派遣軍司令部無意也無力去取締軍隊的犯罪行為。中央對這種情況看不下去，到一月底，參謀總長發出“關於整飭軍紀的訓示” （《軍事警察勤務教程》，載續現代史資料4《軍事警察》，第四二八頁），與此同時，特別派遣高級軍官，著手整飭南京占領軍的軍紀、風紀。
關於這段時間的情況，貝茨博士在遠東國際軍事審判法庭上作證說：“據了解，二月五日或六日左右。來了日本軍的高級軍官，把駐屯在南京的部隊軍官，主要是尉級軍官和下士官集中起來，向他們宣布，為了日本軍的土氣和名譽，必須立即停止這種狀態的發展。但當時未曾聽到採取過什麽有效措施，也未曾聽到對犯有強姦和其他暴行的士兵進行過處罰。 ”（《遠速》，三十六號，載前引資料集1，第五十六頁）
如上述貝茨博士在證詞中所說的那樣，從二月六、七日左右開始，情況有所好轉，如果這是事實，那可以認為，這還是當時東京向南京派遣高級軍官去整頓下級軍官和下士官這一事實所取得的直接效果。如果是確實產生這種效果的話. 那末，中央為什麽不及早採取措施呢？對此，至今甚為遺憾。
大本營派遣陸軍高級武官前往南京，慎重宣布要整飭軍紀，這似乎是外務大臣廣田弘毅同陸軍大臣杉山元大將交涉的結果，因為廣田看到了來自外務省派駐南京機構的報告，也接到了美國駐日大使格魯就日本軍侵犯美國財產而提出的抗議。
根據檢察方麵在遠東國際軍事審判時提出的證據（檢證一九○六），格魯在一月三十一日給美國駐南京、北平（北京）、漢口大使館拍發的電報中說：“今天，大使館陸軍武官在陸軍省得到秘密通知，本間大將（旁註原文如此——譯者）作為大本營的代表前往中國，為防止侵犯外國權益的情況發生，已向鬆井大將下達大本營的訓令。”格魯又在二月四日向國務院拍發的電報中報告說：“今晨九時，向外務大臣遞交了正式通知……大臣作了答覆。最重大的訓令由大本營發出，理應告知在華的各司令官。其主要內容是必須停止這些掠奪行為，並派遣本間少將前往南京進行調查，確保命令的執行。”（在檢證一九○六中，這些電報未在法庭上宣讀。僅一月三十一日的電報收錄在前引書1， 第一六三頁中，二月四日的電報是一九○六一六，第五十六至六十一頁）
貝茨博士認為，日本軍的高級軍官來到南京是在二月五、六日左右，但根據美國駐日大使館的電報，本間少將離開日本似乎是在一月三十一日。鬆井大將在接受遠東國際軍事審判時，對向他提出的反問所作陳述是，本間陸軍少將受參謀本部的派遣，於一月下旬前往他在上海的司令部，說是東京當局看到了關於在華日本兵暴行的有關報告， 非常擔憂（《遠速》，三二○號，載前引書1，第二八五頁）。當時就任外務省東亞局局長石射豬太郎也在上述審判時的宣誓供詞中說：“記得是在一九三八年一月底左右，陸軍中央特別派人前往當地的軍隊。後來知道派來的是本間少將。從此以後，南京大屠殺才停止下來”（《遠速》，二八五號，載前引書1，第二二○頁）。參謀本部第二部部長本間雅睛少將到達南京時，恐怕是在二月一日。
參謀本部以總長的名義發出了關於整飭軍紀的訓令，又派遣本間少將前往當地。其結果，日本兵的暴行終算停下來了，而南京市民消除了不安情緒看來是在二月中旬。
還有一個問題，即關於強姦事件。證人許傳音在遠東國際軍事審判法庭上作證說，也有這種情況：“這種野蠻行為逐漸減少，那是由於日華雙方都為不再發生類似問題而進行努力的結果。要說作了哪些努力，那首先是設立供日本兵遊樂的場所，即安慰所， 以使讓妓女在那裏賣淫。”（《遠速》，三十五號，載前引書1，第三十五頁）