帝登基時，兄弟之中，除允祥外，其餘無不心懷反對者。觀帝首降之諭，即可見大政治家之手段。帝以居喪哀戚，不能詳理國事，特派大臣四人處理之。四人之中，有帝兄弟二人，一為允祥，一即允祀，其餘則一為大學士馬齊，一為帝舅尚書隆科多。允祀本帝所最恨，而亦派此重任者，蓋陽為尊禮，而內以監視之。帝知諸兄弟之中，以允祀為最有心計之人，若無彼居中指揮，則不能有所作為也。允祀奉命派此任之時，眾往慶賀，允祀曰：“予首領且不保，何賀為？”帝偵探廣布，此語亦傳入帝耳焉。時西北正有軍務，允總師於外，帝恐其挾兵為變，乃乘機召之回都。允亦允祀之黨也。帝即位後，亦如其暮年之父，屢下長諭，規勸臣民及其家人。此等性質，清代帝後皆然。唯慈禧太後獨異，不欲多費唇舌，蓋太後乃不肯尋煩惱之人也。今將雍正初年之長諭錄於下，諭曰：“朋黨最為惡習，明季各立門戶，互相陷害，此弊至今未息。惟我皇考允執厥中，至仁在宥，各予保全，不曾戮及一人。爾諸大臣內不無立黨營私者，即宗室中亦或有之。爾等若以向蒙皇考寬大，倖免罪愆，仍蹈前轍，致幹國法，昏昧極矣。豈但滿人，即漢人亦與一家骨肉無異，何苦波累及之。夫人之性情，各有所向，豈有與通國之人，無不投契之理。但辦理公事，不可存私。今諸大臣俱在朕前，朕居藩邸，曾與爾等議及私事，密相往來乎！皇考知朕中立不倚，是以命朕纘承大統。朕自思之，亦惟朕方能不戮一人，無一人不保全耳。朕非獨因皇考付託之重，實感皇考四十餘年教養深恩，委曲周至。言念宏慈，昊天罔極，此朋黨之習。爾諸大臣有則痛改前非，無則永以為戒。爾等當思皇考數十年寬厚之恩，亦當共體朕委曲保全至意。若仍怙惡不悛，朕雖欲勉強仰體皇考聖衷，力為寬宥，豈可得乎！夫朕言是，即宜遵行；朕言非，即宜陳奏。朕未嚐拒也。朕屢詔求言，雖小臣欲進言者，鹹得上達，每多召入，屏去左右，令其麵陳，爾諸大臣非不得陳奏之人，乃隱匿不奏，退有後言，某人不當用，某事不當行，誠小人之惡習也。夫朕所用之人，所行之事，如有不當，爾等身為大臣，何難陳奏。所言果是，朕即用之。如不奏而但肆譏議。設有人詰以不奏之故，能無愧於心耶！賢者朕之所好，爾等即宜好之。不肖者朕之所惡，爾等即宜惡之。乃或其人為朕所信任，盡心竭力於國家之事，則反謂其專擅作威，如此人孰肯效其所為，自取誹謗乎！其或唯諾成風，諸事不問，但思自便其身，為己則得矣，於國何補？夫君親大義也。譬若父之讎則與之相愛，父之愛則與之為讎，為人子者，有是理乎？要之以君之好惡為好惡，然後人人知改其惡，而遷於善。君臣一心，國之福也。傳之萬世亦有令名。爾等其祗承朕諭。”此等諭旨，並無所益。諸兄弟之陰謀仍如前日，而天主教士亦因此損其名譽。蓋諸王之謀逆者，多與教士友善。其中且有已受洗禮者。雍正元年外省上一封奏，言禁耶教事。下禮部議奏，及禮部覆奏言外國教士應一律驅逐，國中教堂均應焚毀。於是各教士皆避往廣州、澳門，而國中教堂三百餘所，均毀壞無遺。帝所以允此奏者，因當時耶穌教士頗牽涉諸王之事，且此事之發源，自康熙末年而已然矣。允祀之黨以允?&、允為著。帝乃派允使蒙古，以孤其黨。但允我至張家口，即逗留不前，且請回京，帝乃行使一種狡猾之手段。以允不法之舉動，令允祀議其罪。允祀奏言應革除允之王爵，並將家產充公，而將其監禁宗人府。帝遂降諭如左。諭曰：“允卑鄙性成，行止妄亂，文學武藝，蒙皇考訓諭數十年，終於一無所成，平生無一事可以上慰皇考聖心，貽皇考一日之悅豫。抑且賦性陰險，既不自知其庸懦無能，又不肯安分守己，恣意倔強。覽廉親王所奏允惡跡，似無虛語。數十年來，朕諸兄弟各人行誼，昭然在人耳目，朕之兄弟知之，舉國孰不知之。諸王大臣等務期各秉公忠，自出意見議奏，倘稍稍有迎合之念，又苟且照廉親王所奏議覆之處，豈獨隳壞爾等臣節，更有何顏瞻拜景陵。且廉親王所奏，或出至誠，或蓄他念，在朕猶自遲疑未信，此事惟賴諸王大臣公忠辦理。著速議具奏。”諸王大臣尋議允奏使不肯前往，捏旨私自進口，不法已極，應革去郡王，撤回佐領，交宗人府永遠禁錮。得旨，允之事，交與允祀者，特以觀其如何處置。向來允、允?&、允等俱聽允祀指示，即便遵行，故朕望允祀教誨伊等，使之改過。乃不但不行教誨，反激成伊等妄為。朕所差遣之處，竟不前往，私回觀望，居住口外數月，又稱奉旨進口，如此不法，任意妄行，惟欲朕將伊等治罪，以受不美之名。豈知此等無禮無義乖戾犯法之弟，治之以罪，適足以昭朕無私之善政。何礙之有？朕今施以恩澤而不知感，喻以法令而不知懼。朕自當明罰敕法，雖係兄弟，亦難姑息。諸王大臣理應將允素行與今所作之罪，明白指陳，或照允祀所議治罪，或加等減等治罪之處，請旨定奪。朕自降諭旨，其後遂定允以革去郡王，交宗人府永遠禁錮之罪。同時宗人府參奏貝子允?&差往西寧居住，擅自遣人往河州買草，踏看牧地，抗違軍法，肆行邊地。請將允?&革去貝子所有屬下佐領，撤出為旗下公中佐領。得旨允?&革去貝子，撤出佐領之處。俱著寬免。帝又作一書，戒廷臣之植黨，中有言曰：“朕在藩邸，甚惡此風，斷不為其所染，廉親王至今與朕結怨，亦即此故。今廉親王之意，不過欲觸朕之怒，多行殺戮，使眾心離散，希圖擾亂國家耳，如此天豈肯如其願乎！古人雲：‘亂臣賊子，人人得而誅之。皇考每引述此語，特指廉親王言之。’雲雲。此乃雍正二年五月之事也。至十一月又下諭曰：“廉親王存心狡詐，結黨營私，自朕繼位以來，凡遇政事，百端阻撓。即如清查工部清片一案，廉親王以重為輕，以輕為重，顛倒錯亂。其從前所犯應議之案，交宗人府議處者，不止數十事，朕俱曲為寬宥，但切加訓誡，冀其改過自新，並未降一階，罰一俸，乃在廷諸臣，向為廉親王所愚，反以朕為過於苛刻，為伊抱屈。此朕審查眾人神色而知之。一年以來大小臣工，因廉親王貽累者，乃甘受罪戾，毫無悔心。而廉親王亦恬然自安，竟不知愧，並不念及國法，稍加儆懼。由此觀之，黨援終不能解散也。黨援必由眾人附和而成，若廉親王一人何所恃而如此行為乎？工部郎中嶽周拖欠錢糧，廉親王私幫數千金，代伊完納。其意以為他人凡事苛刻，而我獨優容加恩。不但邀結嶽周一人，並令所管之人無不感戴。如此沽名邀譽，間不知其何意？嶽周並非無力完項之人，昨伊將現銀二萬兩請託大將軍年羹堯薦伊為布政使，年羹堯據實參奏。朕用人皆出至公。此等小人不止徼幸妄進，並欲使朕之聲名有玷耳。廉親王至今尚無改悔之心，諸臣復不省悟。積習若此，何所底止。朕用是諄諄誡諭，倘諸臣洗心滌慮，盡改前非，則廉親王黨散勢孤，朕得以不傷骨肉手足之情，兼可無負聖祖仁皇帝保全之恩。其令天下臣民鹹知朕意”。允祀之為人，極有心計，嚐欲博取名譽，而加惡名於帝。當其管理理藩部時，擅命蒙古王公除歲首朝賀之外不得入都，亦不賞路費。管工部時，未得帝允擅免諸稅，皆欲以美名歸己，惡名歸帝也。廢太子本監禁於煤山，至是病危，帝命禦醫往視之，覆奏言難望痊癒，帝聞之頗為惻然，欲親臨視疾，又以廢太子為帝之兄，若親往必行君臣之禮，心甚不安，故未往而使人諭之。廢太子聞之，甚為感激，至其死後。帝親往祭奠，又賜以理親王之爵。