可是事隔不久，陸軍就要與美國最討厭的敵人——德國締結針對美國的條約，這自然不能為山本所同意。本來與德國結盟的意圖在於壓迫蘇聯，以有利於日本盡快結束在中國的戰爭，而現在又要同英、法、美為敵，這豈不是違背初衷？山本基於這一理由，支持海軍大臣米內光政在內閣會議中持強硬態度。但陸軍也不相讓，11月1日，德國正式提出條約草案。11月11日，首、陸、海、外、藏五相舉行會議，會上新外相有田八郎就與德國結盟問題作了諒解性的說明，強調"本協定主要是針對蘇聯，但英法等國一旦加入蘇聯方麵則即成為對象，英法等國本身並不是對象。"由此會議才通過了促進早日締結日、德、意三國協定，並決定參考德國方案，迅速製定日本方案。但大島浩與陸軍堅持接受德國方案，不同意隻把蘇聯作為對象。走投無路的近衛內閣，不得已剛過新年便於1939年1月4日提出辭職。
1月5日，樞密院議長平沼駭一郎出麵組閣。在新組建的內閣中，海軍大臣米內、陸軍大臣板垣和外務大臣有田等主要閣臣皆未變動。剛剛成立的平沼內閣碰到的主要問題仍是三國同盟問題。1月6日，德國向日本與義大利重新提出三國同盟方案，其內容與1938年11月1日提出的方案完全一樣。這一次平沼內閣打算在很大程度上滿足德國的願望，但仍沒有走得像陸軍所要求的那麽遠，隻是答應可擴大到蘇聯以外的"第三國"，但如德國直接攻擊蘇聯以外的第三國，而蘇聯未參戰時，日本仍要視情況決定是否援助德國。
這一妥協不為陸軍中的右翼分子所滿足是在預料之中的。剛升任駐德大使的大島浩和駐義大利大使白鳥堅決要求完全接受德國的方案，並在與納粹外長裏賓特洛甫談判時，以欺騙手段答應了德國的要求。對此有所察覺的天皇，特意訓令平沼首相，如果駐外機構不服從國內訓令時應召回或作適當處理。為此內閣迫不得已，改變了過去以電報發出訓令的辦法，而採取派遣由外務、陸軍和海軍組成特使團的辦法，直接到國外去傳達國內的指令。
特使團於2月下旬前往德國和義大利，向大島和白烏兩位大使傳達國內關於締結三國同盟條約的指示。然而，可笑的是這兩位大使不僅不服從政府的指示，反而向外務省提出要按照德國的要求，以蘇聯以外的第三國為對象，包括武力援助在內。由於兩位大使在外拒不執行國內政府的命令，並分別答應裏賓特洛甫和齊亞諾說，在德、意與英法開戰時，日本將負有參戰的義務。這是明目張膽地無視國內指令，超越權限的獨斷專行。海軍大臣米內光政在山本五十六的支持下，堅持要將大島和白鳥召回國內，但遭到陸軍的反對而未果。
到了5月，德國外交部條約局局長高斯提出了妥協案。這個妥協案雖然在表麵上作了若幹讓步，但實質上卻和過去的德國方案沒有什麽區別。5月7日，五相會議研究了高斯方案。陸相和首相主張立即接受，但海相米內堅決反對。為討論三國同盟問題，平沼先後召集了70多次五相會議，每次都毫無結果，一直到8月下旬，平沼辭職。當時社會上襲用江戶時代的做法，編了一首打油詩來形容平沼的窘境：
平沼礙難買鬥米，
隻好——
今日買半鬥，
明日買五升。（五相、五升日語發音相同，意為今日五相，明日復五相。）
德國等得不耐煩了，而日本的答覆就像日本人喜愛的一種套箱一樣，箱子裏麵還套有更小的箱子。於是5月21日，對於日本的遲疑已急不可耐的德國，便先和義大利締結了"鋼鐵盟約"。在這一形勢下，日本國內法西斯分子掀起狂熱的反英運動，海軍首當其衝成為他們攻擊的目標，尤其是山本五十六更成為他們所痛恨的對象。由於海軍大臣米內光政一向寡言少語，看起來十分木訥、柔弱，在社會上有"金魚大臣——裝飾"之稱，因此對海軍的非難主要集中在好鬥的山本身上。社會上到處傳言，說山本是米內的真正後台老板，指責山本是阻止簽訂三國同盟的"絆腳石"和幕後策劃者，是"親英美分子"。就連他參加了一次英國大使館的電影晚會也受到大肆攻擊。
其實事情遠不是如此簡單。日本海軍很早就已經確定美國為其假想敵國，而且在為最後與美國決戰作著嚴格而精心的準備。早在1936年9月，海軍即任命了預備役海軍大將小林臍造為台灣總督，把長期以來一直由文官擔任的台灣總督一職改由海軍武官擔任。接著又在1938年4月，在總督府內新設了一個專門負責籌劃南進政策的海軍武官府，為最後實施南進作準備。1939年2月，帝國海軍完成了對海南島的占領，3月又占領了南中國海戰略地位十分重要的中國南沙群島。海軍的目標是確保日本國家的戰略資源，隻要日本海軍一旦可以——哪怕是短暫的在太平洋上占據優勢，它就可以奪取馬來亞的橡膠和婆羅洲、荷屬東印度的石油而免於從西方進口。那時，也隻有那時，它才可以向西方國家挑戰，同他們公開較量。
顯然，山本等人和陸軍的不同之處就在於如何尋求最有利的時機和最佳的方案，以確保日本立於不敗之地，稱霸西太平洋。從這一點而言，山本所代表的勢力，較之陸軍的無謀，更加陰險狡詐。事後的歷史也證明了這一點。然而，無論山本五十六是如何地從日本帝國擴張的利益出發，在目前的這場爭論中，卻明顯地處於少數人的地位，因而經常受到攻擊也就並不奇怪了。在右翼政黨大日本生產黨的一個團體的決議中，還專門有針對山本五十六的內容：鑑於山本在海軍中影響甚大，成了一些人的精神支柱，現在海軍的觀點和態度主要取決於他，"要搜集山本次官私生活方麵的材料，即他同他的情婦——新橋的藝妓梅龍間來往的情況，以此作為突破口，在社會上把山本搞臭，破壞他的形象。"
1月5日，樞密院議長平沼駭一郎出麵組閣。在新組建的內閣中，海軍大臣米內、陸軍大臣板垣和外務大臣有田等主要閣臣皆未變動。剛剛成立的平沼內閣碰到的主要問題仍是三國同盟問題。1月6日，德國向日本與義大利重新提出三國同盟方案，其內容與1938年11月1日提出的方案完全一樣。這一次平沼內閣打算在很大程度上滿足德國的願望，但仍沒有走得像陸軍所要求的那麽遠，隻是答應可擴大到蘇聯以外的"第三國"，但如德國直接攻擊蘇聯以外的第三國，而蘇聯未參戰時，日本仍要視情況決定是否援助德國。
這一妥協不為陸軍中的右翼分子所滿足是在預料之中的。剛升任駐德大使的大島浩和駐義大利大使白鳥堅決要求完全接受德國的方案，並在與納粹外長裏賓特洛甫談判時，以欺騙手段答應了德國的要求。對此有所察覺的天皇，特意訓令平沼首相，如果駐外機構不服從國內訓令時應召回或作適當處理。為此內閣迫不得已，改變了過去以電報發出訓令的辦法，而採取派遣由外務、陸軍和海軍組成特使團的辦法，直接到國外去傳達國內的指令。
特使團於2月下旬前往德國和義大利，向大島和白烏兩位大使傳達國內關於締結三國同盟條約的指示。然而，可笑的是這兩位大使不僅不服從政府的指示，反而向外務省提出要按照德國的要求，以蘇聯以外的第三國為對象，包括武力援助在內。由於兩位大使在外拒不執行國內政府的命令，並分別答應裏賓特洛甫和齊亞諾說，在德、意與英法開戰時，日本將負有參戰的義務。這是明目張膽地無視國內指令，超越權限的獨斷專行。海軍大臣米內光政在山本五十六的支持下，堅持要將大島和白鳥召回國內，但遭到陸軍的反對而未果。
到了5月，德國外交部條約局局長高斯提出了妥協案。這個妥協案雖然在表麵上作了若幹讓步，但實質上卻和過去的德國方案沒有什麽區別。5月7日，五相會議研究了高斯方案。陸相和首相主張立即接受，但海相米內堅決反對。為討論三國同盟問題，平沼先後召集了70多次五相會議，每次都毫無結果，一直到8月下旬，平沼辭職。當時社會上襲用江戶時代的做法，編了一首打油詩來形容平沼的窘境：
平沼礙難買鬥米，
隻好——
今日買半鬥，
明日買五升。（五相、五升日語發音相同，意為今日五相，明日復五相。）
德國等得不耐煩了，而日本的答覆就像日本人喜愛的一種套箱一樣，箱子裏麵還套有更小的箱子。於是5月21日，對於日本的遲疑已急不可耐的德國，便先和義大利締結了"鋼鐵盟約"。在這一形勢下，日本國內法西斯分子掀起狂熱的反英運動，海軍首當其衝成為他們攻擊的目標，尤其是山本五十六更成為他們所痛恨的對象。由於海軍大臣米內光政一向寡言少語，看起來十分木訥、柔弱，在社會上有"金魚大臣——裝飾"之稱，因此對海軍的非難主要集中在好鬥的山本身上。社會上到處傳言，說山本是米內的真正後台老板，指責山本是阻止簽訂三國同盟的"絆腳石"和幕後策劃者，是"親英美分子"。就連他參加了一次英國大使館的電影晚會也受到大肆攻擊。
其實事情遠不是如此簡單。日本海軍很早就已經確定美國為其假想敵國，而且在為最後與美國決戰作著嚴格而精心的準備。早在1936年9月，海軍即任命了預備役海軍大將小林臍造為台灣總督，把長期以來一直由文官擔任的台灣總督一職改由海軍武官擔任。接著又在1938年4月，在總督府內新設了一個專門負責籌劃南進政策的海軍武官府，為最後實施南進作準備。1939年2月，帝國海軍完成了對海南島的占領，3月又占領了南中國海戰略地位十分重要的中國南沙群島。海軍的目標是確保日本國家的戰略資源，隻要日本海軍一旦可以——哪怕是短暫的在太平洋上占據優勢，它就可以奪取馬來亞的橡膠和婆羅洲、荷屬東印度的石油而免於從西方進口。那時，也隻有那時，它才可以向西方國家挑戰，同他們公開較量。
顯然，山本等人和陸軍的不同之處就在於如何尋求最有利的時機和最佳的方案，以確保日本立於不敗之地，稱霸西太平洋。從這一點而言，山本所代表的勢力，較之陸軍的無謀，更加陰險狡詐。事後的歷史也證明了這一點。然而，無論山本五十六是如何地從日本帝國擴張的利益出發，在目前的這場爭論中，卻明顯地處於少數人的地位，因而經常受到攻擊也就並不奇怪了。在右翼政黨大日本生產黨的一個團體的決議中，還專門有針對山本五十六的內容：鑑於山本在海軍中影響甚大，成了一些人的精神支柱，現在海軍的觀點和態度主要取決於他，"要搜集山本次官私生活方麵的材料，即他同他的情婦——新橋的藝妓梅龍間來往的情況，以此作為突破口，在社會上把山本搞臭，破壞他的形象。"