此時，德國正為日本在東方所點燃的戰火所鼓舞，急於走向大規模的擴張之路。1937年11月，在日本全力進攻中國最大城市上海時，法西斯德國召開會議，通過了《霍斯巴赫備忘錄》，確定了一個大規模擴張計劃和發動戰爭的時間表。為此，希特勒非常希望能與日本締結一個針對英法美的同盟，改變1936年簽定的反共產國際協定中不承擔軍事義務的狀況，以使日本在遙遠的東方牽製德國的仇敵。
1938年1月，日本駐德國使館副武官大島浩前往奧得河畔鬆訥貝格別墅向裏賓特洛南拜年。裏賓特洛甫充滿感情地對大島浩說："我們應該簽訂一個使日、德關係更加親善密切的條約。"此後，兩人即圍繞著兩國締約一事不斷進行秘密接觸。希特勒考慮到德國對華援助政策妨礙了日德同盟，為了贏得日本的好感，乃於1938年2月圖謀改變對華政策，更換了國防軍首腦集團，罷免了牛賴特的外交部長職務，任命裏賓特洛甫繼任外長；接著又撤回了派駐在中國給蔣介石充當軍事顧問的代表團，正式承認偽滿洲國，公開支持日本。德國此舉大得日本歡心。1938年6月，在德國撤回在華軍，事顧問後不久，日本正式決定進一步加強同德國的合作，並就建立軍事同盟與德國開始交涉。為了有利於三國同盟談判的進行，日本在人事上也進行了變動。10月，反對三國同盟談判的駐德大使東鄉茂德調任駐蘇大使，大島浩晉升為駐德大使，直接負責與德國的談判。這個任命是應陸軍參謀本部和陸軍大臣板垣之命作出的。不久又任命另一位更激烈地主張與軸心國締結全麵條約的白鳥為駐意大使。
在與德意結盟問題上，海軍再次與陸軍發生矛盾。盡管海軍也同意加強日、德、意合作，但不同意陸相板垣征四郎主張的"裏賓特洛甫方案"。按裏賓特洛甫方案的原則，日德締結的條約，將不僅是針對蘇聯而且是廣泛針對英、法、美的堅強的軍事同盟。他們認為在日本擴大侵華戰爭後，軍事力量陷入中國戰場，日本在外交上日趨孤立，不宜再與西方國家為敵，以免失去外交上的迴旋餘地和斷絕對英美的貿易；與德國締結的條約隻應是反共產國際協定的繼續，而不應有其他的內容。海軍之所以堅持這一觀點，還因為他們害怕在與德國簽約後會因此而導致日本捲入歐洲戰爭，為德國火中取栗。山本五十六與海軍大臣米內光政是反對與德國結盟的主要人物。山本從海軍的立場出發，認為日本的主要敵人是美國，而日本對美戰爭準備遠遠不夠充分，在這樣的形勢下，與德國結盟是得不到任何好處的。作為日本海軍，在當前準備極不充分的形勢下，應極力避免刺激美國、以美國為敵、同美國作戰，應集中全力解決中國事變，不應再添敵人。山本對陸軍狂熱分子極力主張與德國結盟憂心忡忡，他說："照這樣下去，日本勢必被捲入戰爭，而且是以美國為對手。"
當時，在日本海軍中，隨著永野修身海軍大臣的辭職，海軍省被山本五十六和米內光政的人所控製，執行比較穩定、務實的政策；而過去強硬的艦隊派人員大都集中於軍令部或在艦隊中任職。山本與米內光政在海軍炮術學校任教時曾是同事，二人經常在一起吃飯、練劍，關係比較融洽。在觀點上二人也比較一致，皆傾向於條約派。在永野辭職時，山本為了在內閣中同陸軍相抗衡，極力說服永野推薦米內作為他的繼任者。就這樣，米內才擔任了海軍大臣。
在米內和山本主持下的海軍省，在對美國的戰爭準備上，比陸軍更理智，考慮得更深遠一些。還在1937年12月12日發生"珀內"號事件時，山本就採取了低調撫慰美國的政策。那是在日本攻克上海正向南京發展的時候，美國炮艇"珀內"號載著美國使館的最後一批人員和一群西方記者，拖著美孚石油公司的3艘駁船正撤離烈焰四起的南京城。中午1時，日本海軍航空兵奧山上尉率領1個中隊的轟炸機向"珀內"號撲來，盡管炮艇上有他們可以清楚看到的美國國旗，但已被戰火燒狂了的法西斯分子，還是欣喜若狂地向炮艇衝來。
"他們在丟炸彈，隱蔽！"主舵手大聲喊道。艦長進入操舵室，幾秒鍾後操舵室就被炸彈"轟"的一聲掀開。甲板上，新聞記者諾曼·艾利本能地抓起攝影機拍攝。他不難看清飛行員的麵孔，但使他吃驚的是，日本人明明看得見美國國旗，還是不停地轟炸。20分鍾後，兩條駁船中彈起火，"珀內"號則在長江的濁流中下沉。這時，副艦長阿瑟·安德斯代替受傷的艦長指揮。安德斯由於喉部受傷而不能講話，隻得在一片被血染紅了的紙上潦潦草草地寫上"棄艦"二字。當艦上的最後一批人在江邊蘆葦盪裏隱藏起來時，一艘日本汽艇溯江而上，用機槍向那艘正在下沉的軍艦和兩邊江岸猛烈掃射。兩名美國水手和一名義大利記者喪生。倖存者也麵臨著嚴峻的考驗：他們還得在日本人追趕的情況下堅持兩天才能到中國軍隊前沿。
"珀內"號被擊沉了的消息激怒了美國人，也使山本出了一身冷汗。因為熟知美國歷史的山本十分清楚，本世紀初美國參加的三場有名的帝國主義戰爭之一——美西戰爭，就是因"梅因"號被西班牙擊沉而爆發的。山本十分害怕此時與美國發生糾葛，因而在日本外相照會美國大使館"深表歉意"並願意賠償一切損失的同時，山本也發表聲明："這次事件的責任全在日本方麵，海軍應該誠懇認錯。"並將事件的直接責任者海軍第二聯合航空隊司令三並貞三少將免職查辦。美國由於還不想馬上與日本交戰，也急於使這場危機冷卻下來，所以隻簡單地相信了日本說的日機弄錯了"由內"號的國籍的解釋，在日本向美國交了一張2214007·36美元的賠款支票後，整個事件就算了結。這總算了結了懸在山本心頭上的一樁心事。
1938年1月，日本駐德國使館副武官大島浩前往奧得河畔鬆訥貝格別墅向裏賓特洛南拜年。裏賓特洛甫充滿感情地對大島浩說："我們應該簽訂一個使日、德關係更加親善密切的條約。"此後，兩人即圍繞著兩國締約一事不斷進行秘密接觸。希特勒考慮到德國對華援助政策妨礙了日德同盟，為了贏得日本的好感，乃於1938年2月圖謀改變對華政策，更換了國防軍首腦集團，罷免了牛賴特的外交部長職務，任命裏賓特洛甫繼任外長；接著又撤回了派駐在中國給蔣介石充當軍事顧問的代表團，正式承認偽滿洲國，公開支持日本。德國此舉大得日本歡心。1938年6月，在德國撤回在華軍，事顧問後不久，日本正式決定進一步加強同德國的合作，並就建立軍事同盟與德國開始交涉。為了有利於三國同盟談判的進行，日本在人事上也進行了變動。10月，反對三國同盟談判的駐德大使東鄉茂德調任駐蘇大使，大島浩晉升為駐德大使，直接負責與德國的談判。這個任命是應陸軍參謀本部和陸軍大臣板垣之命作出的。不久又任命另一位更激烈地主張與軸心國締結全麵條約的白鳥為駐意大使。
在與德意結盟問題上，海軍再次與陸軍發生矛盾。盡管海軍也同意加強日、德、意合作，但不同意陸相板垣征四郎主張的"裏賓特洛甫方案"。按裏賓特洛甫方案的原則，日德締結的條約，將不僅是針對蘇聯而且是廣泛針對英、法、美的堅強的軍事同盟。他們認為在日本擴大侵華戰爭後，軍事力量陷入中國戰場，日本在外交上日趨孤立，不宜再與西方國家為敵，以免失去外交上的迴旋餘地和斷絕對英美的貿易；與德國締結的條約隻應是反共產國際協定的繼續，而不應有其他的內容。海軍之所以堅持這一觀點，還因為他們害怕在與德國簽約後會因此而導致日本捲入歐洲戰爭，為德國火中取栗。山本五十六與海軍大臣米內光政是反對與德國結盟的主要人物。山本從海軍的立場出發，認為日本的主要敵人是美國，而日本對美戰爭準備遠遠不夠充分，在這樣的形勢下，與德國結盟是得不到任何好處的。作為日本海軍，在當前準備極不充分的形勢下，應極力避免刺激美國、以美國為敵、同美國作戰，應集中全力解決中國事變，不應再添敵人。山本對陸軍狂熱分子極力主張與德國結盟憂心忡忡，他說："照這樣下去，日本勢必被捲入戰爭，而且是以美國為對手。"
當時，在日本海軍中，隨著永野修身海軍大臣的辭職，海軍省被山本五十六和米內光政的人所控製，執行比較穩定、務實的政策；而過去強硬的艦隊派人員大都集中於軍令部或在艦隊中任職。山本與米內光政在海軍炮術學校任教時曾是同事，二人經常在一起吃飯、練劍，關係比較融洽。在觀點上二人也比較一致，皆傾向於條約派。在永野辭職時，山本為了在內閣中同陸軍相抗衡，極力說服永野推薦米內作為他的繼任者。就這樣，米內才擔任了海軍大臣。
在米內和山本主持下的海軍省，在對美國的戰爭準備上，比陸軍更理智，考慮得更深遠一些。還在1937年12月12日發生"珀內"號事件時，山本就採取了低調撫慰美國的政策。那是在日本攻克上海正向南京發展的時候，美國炮艇"珀內"號載著美國使館的最後一批人員和一群西方記者，拖著美孚石油公司的3艘駁船正撤離烈焰四起的南京城。中午1時，日本海軍航空兵奧山上尉率領1個中隊的轟炸機向"珀內"號撲來，盡管炮艇上有他們可以清楚看到的美國國旗，但已被戰火燒狂了的法西斯分子，還是欣喜若狂地向炮艇衝來。
"他們在丟炸彈，隱蔽！"主舵手大聲喊道。艦長進入操舵室，幾秒鍾後操舵室就被炸彈"轟"的一聲掀開。甲板上，新聞記者諾曼·艾利本能地抓起攝影機拍攝。他不難看清飛行員的麵孔，但使他吃驚的是，日本人明明看得見美國國旗，還是不停地轟炸。20分鍾後，兩條駁船中彈起火，"珀內"號則在長江的濁流中下沉。這時，副艦長阿瑟·安德斯代替受傷的艦長指揮。安德斯由於喉部受傷而不能講話，隻得在一片被血染紅了的紙上潦潦草草地寫上"棄艦"二字。當艦上的最後一批人在江邊蘆葦盪裏隱藏起來時，一艘日本汽艇溯江而上，用機槍向那艘正在下沉的軍艦和兩邊江岸猛烈掃射。兩名美國水手和一名義大利記者喪生。倖存者也麵臨著嚴峻的考驗：他們還得在日本人追趕的情況下堅持兩天才能到中國軍隊前沿。
"珀內"號被擊沉了的消息激怒了美國人，也使山本出了一身冷汗。因為熟知美國歷史的山本十分清楚，本世紀初美國參加的三場有名的帝國主義戰爭之一——美西戰爭，就是因"梅因"號被西班牙擊沉而爆發的。山本十分害怕此時與美國發生糾葛，因而在日本外相照會美國大使館"深表歉意"並願意賠償一切損失的同時，山本也發表聲明："這次事件的責任全在日本方麵，海軍應該誠懇認錯。"並將事件的直接責任者海軍第二聯合航空隊司令三並貞三少將免職查辦。美國由於還不想馬上與日本交戰，也急於使這場危機冷卻下來，所以隻簡單地相信了日本說的日機弄錯了"由內"號的國籍的解釋，在日本向美國交了一張2214007·36美元的賠款支票後，整個事件就算了結。這總算了結了懸在山本心頭上的一樁心事。