陳獨秀這裏對辛亥革命錯誤的批評和教訓的總結，雖然包括辛亥年推翻清朝統治後北洋軍閥統治時期的情況，但「專做軍事行動而忽略了民眾的政治宣傳；專排滿而放鬆了帝國主義侵略」，卻點中了1924年與共產黨合作前的同盟會、國民黨領導革命活動錯誤的要害，同時也可以解釋為什麽他在1903年拒俄運動後，不參加同盟會、國民黨，不積極參加他們領導的武裝起義，自己也不發動起義的主要原因。
顯然，對於如何進行反清革命，陳獨秀有自己的看法，認為至少要做到兩點：第一，必須在發動民眾的基礎上進行軍事行動，即民眾與軍事行動相結合；第二，推翻清朝統治必須與取消帝國主義在華特權同時進行，即反封建與反帝相結合。但是，這種主張太理性了，在當時同盟會的排滿革命綱領得到熱烈響應、廣大民眾和革命者的覺悟還沒有提高到把反帝與反封建放在同等重要位置上進行的時候，陳獨秀的這種主張隻能是曲高和寡的，而陳獨秀又是一個很有主見，不隨俗流，不怕孤立的人。
學習、思考、彷徨的三年
從1906年下半年開始，當局開始加強對安徽公學、初級師範學堂管製，更對陳獨秀與革命黨人的聯絡機關科學圖書社嚴密監視，革命活動的環境惡化，「奸民候補道汪雲浦告密於恩銘，恩銘大怒，欲窮治之，羽書連下」。[47]於是，蕪湖偵探密布，端方還擬出了逮捕的名單。革命黨人紛紛離開學校，李光炯也暫避九華山。挨到1907年春，陳獨秀也不得不再度赴日。
1901～1915年，陳獨秀多次赴日留學或逃亡避難。當時許多青年和革命者也都是如此。在1920年陳獨秀為首的中共發起組向俄國派送留學生以前，日本是培養中國早期具有現代科學知識的知識分子和民主及社會主義思想革命者的搖籃。這些青年之所以如此輕易來往於中日之間，一個重要原因是當時沒有像現在這樣的嚴格審查與煩瑣的手續。一位當時的留學生後來回憶說：「日本是外國，自不必說。拿現在的標準來說，赴外國留學，不知在國內先要費多少時間，辦理出國手續；並須請駐在中國的日本領事官，為我們簽證護照，方能起程。但那時候一切手續都不要。中國政府對於出國的人民，都絕對不管。隻要你有錢，什麽時候願意去日本，你就去；什麽時候願意回國，你就回。絕對不受留難。而日本方麵，對於中國人，也絕對許其自由出入，不要護照。」[48]這位回憶者還說，當時去日本的旅費也不貴，以1915年他去日本的旅費為例：由上海乘日輪到日本橫濱船票，統艙，隻需15元國幣；而坐船由上海到長崎，再乘火車到東京更便宜，船票7.5元國幣，火車7.5日元。當時國幣與日元幣值幾乎相等。
陳獨秀這次赴日本，入東京正則英語學校，專攻英語。2004年筆者應日本東京大學佐佐木·カ和慶應義塾大學教授長堀祐造邀請，赴日學術訪問，曾參觀正在移地擴建中的該校，現在它已成為日本著名的多語種的外語大學。該校提供的歷史資料表明，陳獨秀在校期間，用的是該校創辦人自編而各個大學普遍使用的模範英文教科書，所以吸引了如陳獨秀那樣許多外國學生。正如後來中國著名評論家王森然所述，以陳獨秀的天賦，力求創新的學習和研究方法，不論哪門學問，隻要被他用心關注，必然成績優異而且總有獨到見解。三年以後，他竟然為當時著名的群益書社編輯出版了一部《模範英文教本》（四冊）。當時的gg這樣寫道：
陳獨秀著 模範英文教本
是書英名lesson，乃揉合會話、文法、翻譯而為之，且譯之以國文焉。蓋習外國文與本國文異趣，必於讀書文法外加讀是書，始易於曲喻而灼解也，其編製體裁，係由淺入深，由簡之繁，別為四冊。第一冊釋八種詞之要略，第二冊釋各種詞之不規別法，第三冊釋各種詞之特別要點，第四冊動詞之各種用法（mode、infinitive之類）及各種前置詞之用法，措辭嚴潔，引例顯豁，先生得意之作也。
可見陳獨秀對這次英文學習用心之深。而且此書必然借鑑日本正則學校的教科書不少。陳獨秀這次留學日本時間最長，除了第二年秋天短期應邀回國參加安徽教育總會召開的教育大會、在會上發表改良教育的講話之外，在日本約有兩年。除英文外，還學習了法文，這無疑是與他獨鍾法蘭西文明，特別是法國資產階級民主主義學說有關。後來他創辦《青年雜誌》（第二年改名為《新青年》）封麵上，用的詞就是法文 jeunsse」。
因此，由於過去對陳獨秀1907～1909年的行蹤不清，有人曾以為他到法國去留學了。為此，1902～1912年先後在法國的李石曾和李書華寫信給正在作《陳獨秀年譜》的郅玉如先生證明：陳獨秀「未到過法國」。[49]所以，他是在日本學的法文。日本學者中島長文在《陳獨秀年譜長編初稿》中曾說陳獨秀在1914年還在日本「雅典娜法語學院」學過法語。另一位日本學者曾是這座學校的學生，在回憶文章《阪口安吾待過的雅典娜法語學院》中，也引用過這條材料。雖然該校的資料已經毀滅，此說無從查實，但應該是可信的。筆者2004年訪問該校時，發現該校最早是1913年東京外國語學校的一部分，課程是「高等法語」，第二年在日本學者丸山順太郎的協助下，才加設初等科。這說明陳獨秀在該校的初等科一開始就加入了進去。筆者參觀時，該校已經遷到東京都千代田區神田駿河台建築了雄偉別致的校舍，並且成了法語為主、兼學英語等多種語言的外語大學。該校如陳獨秀所主張的那樣，教學相當靈活，有入門科、本科（初級、中級、高級）、專科、視聽會話科、夏秋旅遊研修課等。
顯然，對於如何進行反清革命，陳獨秀有自己的看法，認為至少要做到兩點：第一，必須在發動民眾的基礎上進行軍事行動，即民眾與軍事行動相結合；第二，推翻清朝統治必須與取消帝國主義在華特權同時進行，即反封建與反帝相結合。但是，這種主張太理性了，在當時同盟會的排滿革命綱領得到熱烈響應、廣大民眾和革命者的覺悟還沒有提高到把反帝與反封建放在同等重要位置上進行的時候，陳獨秀的這種主張隻能是曲高和寡的，而陳獨秀又是一個很有主見，不隨俗流，不怕孤立的人。
學習、思考、彷徨的三年
從1906年下半年開始，當局開始加強對安徽公學、初級師範學堂管製，更對陳獨秀與革命黨人的聯絡機關科學圖書社嚴密監視，革命活動的環境惡化，「奸民候補道汪雲浦告密於恩銘，恩銘大怒，欲窮治之，羽書連下」。[47]於是，蕪湖偵探密布，端方還擬出了逮捕的名單。革命黨人紛紛離開學校，李光炯也暫避九華山。挨到1907年春，陳獨秀也不得不再度赴日。
1901～1915年，陳獨秀多次赴日留學或逃亡避難。當時許多青年和革命者也都是如此。在1920年陳獨秀為首的中共發起組向俄國派送留學生以前，日本是培養中國早期具有現代科學知識的知識分子和民主及社會主義思想革命者的搖籃。這些青年之所以如此輕易來往於中日之間，一個重要原因是當時沒有像現在這樣的嚴格審查與煩瑣的手續。一位當時的留學生後來回憶說：「日本是外國，自不必說。拿現在的標準來說，赴外國留學，不知在國內先要費多少時間，辦理出國手續；並須請駐在中國的日本領事官，為我們簽證護照，方能起程。但那時候一切手續都不要。中國政府對於出國的人民，都絕對不管。隻要你有錢，什麽時候願意去日本，你就去；什麽時候願意回國，你就回。絕對不受留難。而日本方麵，對於中國人，也絕對許其自由出入，不要護照。」[48]這位回憶者還說，當時去日本的旅費也不貴，以1915年他去日本的旅費為例：由上海乘日輪到日本橫濱船票，統艙，隻需15元國幣；而坐船由上海到長崎，再乘火車到東京更便宜，船票7.5元國幣，火車7.5日元。當時國幣與日元幣值幾乎相等。
陳獨秀這次赴日本，入東京正則英語學校，專攻英語。2004年筆者應日本東京大學佐佐木·カ和慶應義塾大學教授長堀祐造邀請，赴日學術訪問，曾參觀正在移地擴建中的該校，現在它已成為日本著名的多語種的外語大學。該校提供的歷史資料表明，陳獨秀在校期間，用的是該校創辦人自編而各個大學普遍使用的模範英文教科書，所以吸引了如陳獨秀那樣許多外國學生。正如後來中國著名評論家王森然所述，以陳獨秀的天賦，力求創新的學習和研究方法，不論哪門學問，隻要被他用心關注，必然成績優異而且總有獨到見解。三年以後，他竟然為當時著名的群益書社編輯出版了一部《模範英文教本》（四冊）。當時的gg這樣寫道：
陳獨秀著 模範英文教本
是書英名lesson，乃揉合會話、文法、翻譯而為之，且譯之以國文焉。蓋習外國文與本國文異趣，必於讀書文法外加讀是書，始易於曲喻而灼解也，其編製體裁，係由淺入深，由簡之繁，別為四冊。第一冊釋八種詞之要略，第二冊釋各種詞之不規別法，第三冊釋各種詞之特別要點，第四冊動詞之各種用法（mode、infinitive之類）及各種前置詞之用法，措辭嚴潔，引例顯豁，先生得意之作也。
可見陳獨秀對這次英文學習用心之深。而且此書必然借鑑日本正則學校的教科書不少。陳獨秀這次留學日本時間最長，除了第二年秋天短期應邀回國參加安徽教育總會召開的教育大會、在會上發表改良教育的講話之外，在日本約有兩年。除英文外，還學習了法文，這無疑是與他獨鍾法蘭西文明，特別是法國資產階級民主主義學說有關。後來他創辦《青年雜誌》（第二年改名為《新青年》）封麵上，用的詞就是法文 jeunsse」。
因此，由於過去對陳獨秀1907～1909年的行蹤不清，有人曾以為他到法國去留學了。為此，1902～1912年先後在法國的李石曾和李書華寫信給正在作《陳獨秀年譜》的郅玉如先生證明：陳獨秀「未到過法國」。[49]所以，他是在日本學的法文。日本學者中島長文在《陳獨秀年譜長編初稿》中曾說陳獨秀在1914年還在日本「雅典娜法語學院」學過法語。另一位日本學者曾是這座學校的學生，在回憶文章《阪口安吾待過的雅典娜法語學院》中，也引用過這條材料。雖然該校的資料已經毀滅，此說無從查實，但應該是可信的。筆者2004年訪問該校時，發現該校最早是1913年東京外國語學校的一部分，課程是「高等法語」，第二年在日本學者丸山順太郎的協助下，才加設初等科。這說明陳獨秀在該校的初等科一開始就加入了進去。筆者參觀時，該校已經遷到東京都千代田區神田駿河台建築了雄偉別致的校舍，並且成了法語為主、兼學英語等多種語言的外語大學。該校如陳獨秀所主張的那樣，教學相當靈活，有入門科、本科（初級、中級、高級）、專科、視聽會話科、夏秋旅遊研修課等。