地球聯合理事會(ued)一直在觀察泰倫、異蟲和星靈之間的衝突。現在，他們從地球派遣了一支規模龐大的艦隊進入科普盧星區，意圖對這一星區實施控製。為了實現這一目標，ued在異蟲的巢穴行星查爾捕獲了一個幼年主宰。刀鋒女王、蒙斯克、雷諾和星靈暫時放下了彼此之間的分歧，集結各自的力量，意圖擊敗ued和新主宰。這個看似不可能形成的聯盟最終實現了他們的目標。在第二個主宰死後，刀鋒女王獲得了全科普盧星區的異蟲控製權。
在查爾附近一顆未在星圖上標明的衛星上，澤拉圖遇到了泰倫人薩米爾·杜蘭。這個人曾經是刀鋒女王的盟友。澤拉圖發現杜蘭已經成功地將異蟲和星靈的dna拚接在一起，創造出一種融合生命體。憑藉這種全新的生命形式，杜蘭發出恐怖的預言：整個宇宙將因之而發生徹底的改變。
阿克圖爾斯·蒙斯克殲滅了自己手下的半數幽靈部隊，為的是確保參與帝國幽靈計劃的前聯邦人員絕對忠誠於他。同時，他在克哈iv的衛星烏薩上建立了新的幽靈學院。
科爾賓·弗爾斯要將他的兒子科林藏匿起來，以避免他會落入帝國的手中，成為帝國探索人類靈能天賦的實驗品。為此，科爾賓逃往尤摩揚護國軍尋求庇護。這是一個獨立於帝國之外的泰倫人政府。
年輕的科林·弗爾斯被帝國捉獲，並被送往幽靈學院。與此同時，他的父親科爾賓成為了尤摩揚護國軍中聲討帝國罪行的重要人物。因為對帝國毫不掩飾的敵意，科爾賓成為了帝國必欲除之而後快的暗殺目標。
2501年
諾娃·泰拉避開了故鄉塔桑尼斯的毀滅，與其他擁有靈能天賦的泰倫人一同接受訓練，在幽靈學院中磨礪自身的靈能控製技藝。
諾娃遇到了科林·弗爾斯。當時學院正全力以赴對科林進行研究，試圖駕馭他獨特的能力。與此同時，四名諾娃的舊日同袍被困在礦業行星沙伊，正為了抵抗異蟲的屠殺而急切地尋找著援兵。
2502年
阿克圖爾斯·蒙斯克找到了他的兒子瓦倫裏安。瓦倫裏安在成長過程中幾乎沒有受到父親的影響。阿克圖爾斯希望瓦倫裏安能夠繼續蒙斯克王朝的統治，並回憶起自己從一個懵懂無知的少年一步步成為泰倫皇帝的過程。
unn播報員凱特·洛克維爾進入到帝國軍隊之中。她的任務是向unn提供支持帝國的各種愛國報導。但在與士兵們共處的時間中，她遇到了前unn播報員邁克·利伯蒂，並發現了帝國華麗表麵下的一些黑暗事實。
塔姆森·考利計劃消滅已經解散的“戰地豪豬”成員，以掩蓋他先前刺殺阿克圖爾斯·蒙斯克的未遂陰謀。在進行這一步計劃之前，他召集了“戰地豪豬”，命令他們刺殺吉姆·雷諾。考利相信這一行動能夠為他贏得蒙斯克的寵幸。一名“戰地豪豬”科爾·希克森受命執行這個任務，而這名前聯邦士兵曾經幫助雷諾在殘酷的凱莫瑞安戰俘營中活下來。
科普盧星區的全部三股勢力——泰倫、星靈和異蟲之間為了控製阿提卡行星上一座古老的薩爾納加神廟而爆發了激烈的戰鬥。在激烈的拚殺中，這些戰士才逐漸看清了將他們捲入這片混亂戰場的各自不同的動機。
凱莫瑞安的“大眾利益”團隊到達了一座偏遠荒涼的行星，希望能掠取到一些屬於這顆行星原居民的財產。當這些凱莫瑞安人在廢墟中搜索的時候，他們發現了隱藏在這顆行星失蹤居民背後的恐怖秘密。
一隊星靈科學家對異蟲菌毯樣品進行試驗，從外部提供營養，支持這種異蟲結構生長。這種營養物質對星靈科學家們產生了怪異的影響，最終讓他們的意識一步步墮入了瘋狂。
發瘋的維京戰機駕駛員喬恩·迪勒上尉，在一次武器展示中對無辜的烏薩居民發動了攻擊。他曾經的學生韋斯·卡特在這次攻擊中成為了戴瑞的對手，他必須結束喬恩·迪勒的殺戮狂歡。
桑丁·福斯特是一名技藝高超的雷神駕駛員，並且有兩位忠心耿耿的助手。他們駕駛雷神闖進了瑪·薩拉的一片泰倫基地廢墟中。他們的目標是這片廢墟裏的一個密室。直到他們到達自己的目的地，福斯特才發現，他所期望的寶藏是絕不應該被發掘出來的。
2503年
帝國科學家們捉住了星靈執行官莫杜恩，並將他作為實驗對象，希望藉此對星靈的靈能形態——卡拉——有更加深入的了解。在瘋狂科學家斯坦利·伯蓋斯博士的領導下，這些研究者在尋求權力的道路上打破了所有的倫理底線。
考古學家傑克·拉姆西對一座薩爾納加神廟進行考察，但情況迅速失去了控製——一個自稱為“守護者”的神秘星靈出現在他的腦海中。隨後，傑克的意識就完全被關於星靈歷史的洪流所淹沒了。
傑克·拉姆西的冒險在艾爾行星上繼續著。星靈守護者在他的腦海中指引他探索這顆行星地表深處的陰影迷宮，讓他找到了一顆神聖的水晶。這是一件也許能拯救整個宇宙的聖物。
帝國的一些精英幽靈神秘失蹤。此時，諾娃·泰拉已經從幽靈學院畢業，並她擔負起了調查這些失蹤案件的任務，由此發現了一個可怕的秘密。
在查爾附近一顆未在星圖上標明的衛星上，澤拉圖遇到了泰倫人薩米爾·杜蘭。這個人曾經是刀鋒女王的盟友。澤拉圖發現杜蘭已經成功地將異蟲和星靈的dna拚接在一起，創造出一種融合生命體。憑藉這種全新的生命形式，杜蘭發出恐怖的預言：整個宇宙將因之而發生徹底的改變。
阿克圖爾斯·蒙斯克殲滅了自己手下的半數幽靈部隊，為的是確保參與帝國幽靈計劃的前聯邦人員絕對忠誠於他。同時，他在克哈iv的衛星烏薩上建立了新的幽靈學院。
科爾賓·弗爾斯要將他的兒子科林藏匿起來，以避免他會落入帝國的手中，成為帝國探索人類靈能天賦的實驗品。為此，科爾賓逃往尤摩揚護國軍尋求庇護。這是一個獨立於帝國之外的泰倫人政府。
年輕的科林·弗爾斯被帝國捉獲，並被送往幽靈學院。與此同時，他的父親科爾賓成為了尤摩揚護國軍中聲討帝國罪行的重要人物。因為對帝國毫不掩飾的敵意，科爾賓成為了帝國必欲除之而後快的暗殺目標。
2501年
諾娃·泰拉避開了故鄉塔桑尼斯的毀滅，與其他擁有靈能天賦的泰倫人一同接受訓練，在幽靈學院中磨礪自身的靈能控製技藝。
諾娃遇到了科林·弗爾斯。當時學院正全力以赴對科林進行研究，試圖駕馭他獨特的能力。與此同時，四名諾娃的舊日同袍被困在礦業行星沙伊，正為了抵抗異蟲的屠殺而急切地尋找著援兵。
2502年
阿克圖爾斯·蒙斯克找到了他的兒子瓦倫裏安。瓦倫裏安在成長過程中幾乎沒有受到父親的影響。阿克圖爾斯希望瓦倫裏安能夠繼續蒙斯克王朝的統治，並回憶起自己從一個懵懂無知的少年一步步成為泰倫皇帝的過程。
unn播報員凱特·洛克維爾進入到帝國軍隊之中。她的任務是向unn提供支持帝國的各種愛國報導。但在與士兵們共處的時間中，她遇到了前unn播報員邁克·利伯蒂，並發現了帝國華麗表麵下的一些黑暗事實。
塔姆森·考利計劃消滅已經解散的“戰地豪豬”成員，以掩蓋他先前刺殺阿克圖爾斯·蒙斯克的未遂陰謀。在進行這一步計劃之前，他召集了“戰地豪豬”，命令他們刺殺吉姆·雷諾。考利相信這一行動能夠為他贏得蒙斯克的寵幸。一名“戰地豪豬”科爾·希克森受命執行這個任務，而這名前聯邦士兵曾經幫助雷諾在殘酷的凱莫瑞安戰俘營中活下來。
科普盧星區的全部三股勢力——泰倫、星靈和異蟲之間為了控製阿提卡行星上一座古老的薩爾納加神廟而爆發了激烈的戰鬥。在激烈的拚殺中，這些戰士才逐漸看清了將他們捲入這片混亂戰場的各自不同的動機。
凱莫瑞安的“大眾利益”團隊到達了一座偏遠荒涼的行星，希望能掠取到一些屬於這顆行星原居民的財產。當這些凱莫瑞安人在廢墟中搜索的時候，他們發現了隱藏在這顆行星失蹤居民背後的恐怖秘密。
一隊星靈科學家對異蟲菌毯樣品進行試驗，從外部提供營養，支持這種異蟲結構生長。這種營養物質對星靈科學家們產生了怪異的影響，最終讓他們的意識一步步墮入了瘋狂。
發瘋的維京戰機駕駛員喬恩·迪勒上尉，在一次武器展示中對無辜的烏薩居民發動了攻擊。他曾經的學生韋斯·卡特在這次攻擊中成為了戴瑞的對手，他必須結束喬恩·迪勒的殺戮狂歡。
桑丁·福斯特是一名技藝高超的雷神駕駛員，並且有兩位忠心耿耿的助手。他們駕駛雷神闖進了瑪·薩拉的一片泰倫基地廢墟中。他們的目標是這片廢墟裏的一個密室。直到他們到達自己的目的地，福斯特才發現，他所期望的寶藏是絕不應該被發掘出來的。
2503年
帝國科學家們捉住了星靈執行官莫杜恩，並將他作為實驗對象，希望藉此對星靈的靈能形態——卡拉——有更加深入的了解。在瘋狂科學家斯坦利·伯蓋斯博士的領導下，這些研究者在尋求權力的道路上打破了所有的倫理底線。
考古學家傑克·拉姆西對一座薩爾納加神廟進行考察，但情況迅速失去了控製——一個自稱為“守護者”的神秘星靈出現在他的腦海中。隨後，傑克的意識就完全被關於星靈歷史的洪流所淹沒了。
傑克·拉姆西的冒險在艾爾行星上繼續著。星靈守護者在他的腦海中指引他探索這顆行星地表深處的陰影迷宮，讓他找到了一顆神聖的水晶。這是一件也許能拯救整個宇宙的聖物。
帝國的一些精英幽靈神秘失蹤。此時，諾娃·泰拉已經從幽靈學院畢業，並她擔負起了調查這些失蹤案件的任務，由此發現了一個可怕的秘密。