1809年7月6日上午，法軍進攻瓦格拉姆的號角吹響了。數百門大炮一起開火，猛轟奧軍中央陣地。各軍團在炮火的掩護下奮勇前進。這時，達武軍已突入敵軍左翼陣地，並開始向瓦格拉姆方向進擊。左翼奧軍頑強抵抗，終因傷亡過重，放棄陣地潰逃。左翼潰敗使得中央奧軍處於不利狀態，法軍中央和右翼部隊乘勢猛攻。中央麥克唐納軍團的26營人排成每邊長達一公裏的方陣，率先向敵軍中央陣地席捲而去。盡管損失重大，最終還是突破了奧軍中心，後麵的部隊隨之而來。奧軍被迫全線後退。下午4時，查理大公得知他望眼欲穿的援軍即他弟弟約翰大公的部隊還在十多公裏之外，不覺大失所望。至此，他那用弧形防線圍殲法軍的計劃已基本失敗，他雖把法軍已誘進他的網裏，但他已沒有力量拉起網來，反倒讓法軍打穿了網底。傍晚時分，查理大公見取勝無望，便下令全線撤退。奧軍有秩序地撤出戰場，留給法軍的戰利品隻不過是9門火炮和一麵軍旗。
瓦格拉姆一戰，奧軍死傷32000餘人，被俘7500餘人，其損失不亞於奧斯特裏茨戰役。然而，法軍付出的代價也是極其高昂的，法軍損失了27000人。麥克唐納因在這次戰鬥中表現突出，榮獲殊榮，拿破崙在戰場上授給他元帥節杖。
此後整整一個星期內，法軍都在繼續追擊退卻中的奧軍。7月11日，奧皇弗蘭西斯派出使者，請求休戰，拿破崙欣然同意，但提出了苛刻條件：凡是法軍在休戰時刻已經到達的地方，哪怕隻有幾名法軍到達，奧軍都要撤走，而且在最後和約簽訂之前，這些奧軍應留在法軍手裏作為人質。奧皇不得不對這些條件表示同意。
談判開始了，泄了氣的奧皇準備忍受一切。他現在開始咒罵那些促使他進行這場戰爭的人。他清楚地記得在瓦格拉姆戰鬥之前拿破崙是怎樣懲罰教皇的，那麽瓦格拉姆戰鬥之後的奧地利又將是什麽命運呢？他實在不敢想下去。
雙方在肖恩布魯恩宮開始訂約談判。拿破崙開出的條件是：奧地利必須割讓一部分土地給法蘭西帝國，割讓另一部分土地給華沙大公國和俄國，同時付出13400萬法郎的戰爭賠款，將軍隊的人數限製在15萬人以內，繼續執行抵製英國商品的大陸封鎖政策。奧地利不甘心作出如此巨大的犧牲，他們與拿破崙討價還價，反覆懇求放寬一點條件，但勝利者毫不讓步。談判一直拖延下去，奧國認為一旦拿破崙在西班牙有新的失敗，他們就會有個談判的好機會，所以他們在等待時機。而拿破崙呢？盡管他希望盡快締結和約，以便把全部力量指向西班牙和英國，但他不能輕易放過奧地利，他要給他的帝國樹立威信，要讓整個德意誌對他俯首貼耳。因此，不管奧國怎樣懇求，或施展詭計，都無濟於事。談判的結局似乎一天比一天遠，然而，一件意想不到的事情的發生促使了這個條約的盡快簽訂。
拿破崙每天清晨6點鍾都在肖恩布魯恩宮前檢閱軍隊。每逢這種場合，總是有許多人前來一睹拿破崙的風采。1809年10月13日這一天，閱兵儀式剛要結束，一位穿著整齊的年輕人穿過隨從人員乘坐的馬匹，朝騎在馬上的拿破崙走去。貝爾蒂埃發現這位年輕人形跡可疑，便攔住了他，這位年輕人說要親自向拿破崙呈交一份請願書。貝爾蒂埃從他的眼神裏看到了一種特別的表情，一種似乎是下了某種決心的表情，當即警覺起來。當這位年輕人不顧勸阻再次向拿破崙走去時，貝爾蒂埃示意一名近衛軍軍官上去逮捕他。年輕人未加抵抗就束手就擒了，從他的身上搜出了一把大餐刀。由於這一切都是在瞬間發生的，大家又都專心致誌地注視著閱兵式，誰也不曾注意到這一幕。
檢閱完畢後，拿破崙命人將刺客帶到麵前。這位年輕人大約隻有19歲，臉色白皙，看上去文靜柔弱。他供認自己是從瑙姆堡來的一位大學生。拿破崙豈不及待地想知道這個受過良好教育的青年為什麽這麽幹，他急切地問道：“你為什麽要殺我？""因為你毀滅了我的國家。""我傷害了你嗎？""同對所有德國人的傷害一樣。""你是第一次見到我嗎？""我在愛爾富特見過你，你同俄國皇帝會晤的時候。""那時候你想殺我嗎？""不，我以為你不會再對我們的國家進行戰爭。我曾對你萬分崇拜。一星期前我來到肖恩布魯恩，目的是殺死你。可我到達時，閱兵式剛剛結束。所以，我推遲到今天來實行我的意圖。""在我的士兵中間殺死我，你打算怎樣逃跑？”“我知道麵臨的是怎樣的危險，我甚至吃驚自己還活著。"拿破崙被青年人這種鎮定的態度觸動了，他沉默片刻後，又把目光落在年輕人的身上，年輕人在他的逼視下仍然泰然自若。拿破崙繼續問道：”如果我現在馬上把你釋放了，你將去做什麽呢？""我還會伺機幹掉你的。"拿破崙又一次沉默了。隨後他自言自語道：“這個青年人不是有病，便是個瘋子。”
第二天，拿破崙召來同奧地利談判的大臣特。香巴尼先生，"談判進行得怎樣了？"他問道。香巴尼說談判已經擱置，拿破崙接著說：“我希望馬上恢復談判。我希望為了和平，不要為奧地利的賠款少幾百萬而猶豫不決，在那點上讓步。我希望有個結局，我完全交給你辦了。"香巴尼立即執行拿破崙的命令。當晚，雙方談判代表開始討論擱置起來的和約條文。
瓦格拉姆一戰，奧軍死傷32000餘人，被俘7500餘人，其損失不亞於奧斯特裏茨戰役。然而，法軍付出的代價也是極其高昂的，法軍損失了27000人。麥克唐納因在這次戰鬥中表現突出，榮獲殊榮，拿破崙在戰場上授給他元帥節杖。
此後整整一個星期內，法軍都在繼續追擊退卻中的奧軍。7月11日，奧皇弗蘭西斯派出使者，請求休戰，拿破崙欣然同意，但提出了苛刻條件：凡是法軍在休戰時刻已經到達的地方，哪怕隻有幾名法軍到達，奧軍都要撤走，而且在最後和約簽訂之前，這些奧軍應留在法軍手裏作為人質。奧皇不得不對這些條件表示同意。
談判開始了，泄了氣的奧皇準備忍受一切。他現在開始咒罵那些促使他進行這場戰爭的人。他清楚地記得在瓦格拉姆戰鬥之前拿破崙是怎樣懲罰教皇的，那麽瓦格拉姆戰鬥之後的奧地利又將是什麽命運呢？他實在不敢想下去。
雙方在肖恩布魯恩宮開始訂約談判。拿破崙開出的條件是：奧地利必須割讓一部分土地給法蘭西帝國，割讓另一部分土地給華沙大公國和俄國，同時付出13400萬法郎的戰爭賠款，將軍隊的人數限製在15萬人以內，繼續執行抵製英國商品的大陸封鎖政策。奧地利不甘心作出如此巨大的犧牲，他們與拿破崙討價還價，反覆懇求放寬一點條件，但勝利者毫不讓步。談判一直拖延下去，奧國認為一旦拿破崙在西班牙有新的失敗，他們就會有個談判的好機會，所以他們在等待時機。而拿破崙呢？盡管他希望盡快締結和約，以便把全部力量指向西班牙和英國，但他不能輕易放過奧地利，他要給他的帝國樹立威信，要讓整個德意誌對他俯首貼耳。因此，不管奧國怎樣懇求，或施展詭計，都無濟於事。談判的結局似乎一天比一天遠，然而，一件意想不到的事情的發生促使了這個條約的盡快簽訂。
拿破崙每天清晨6點鍾都在肖恩布魯恩宮前檢閱軍隊。每逢這種場合，總是有許多人前來一睹拿破崙的風采。1809年10月13日這一天，閱兵儀式剛要結束，一位穿著整齊的年輕人穿過隨從人員乘坐的馬匹，朝騎在馬上的拿破崙走去。貝爾蒂埃發現這位年輕人形跡可疑，便攔住了他，這位年輕人說要親自向拿破崙呈交一份請願書。貝爾蒂埃從他的眼神裏看到了一種特別的表情，一種似乎是下了某種決心的表情，當即警覺起來。當這位年輕人不顧勸阻再次向拿破崙走去時，貝爾蒂埃示意一名近衛軍軍官上去逮捕他。年輕人未加抵抗就束手就擒了，從他的身上搜出了一把大餐刀。由於這一切都是在瞬間發生的，大家又都專心致誌地注視著閱兵式，誰也不曾注意到這一幕。
檢閱完畢後，拿破崙命人將刺客帶到麵前。這位年輕人大約隻有19歲，臉色白皙，看上去文靜柔弱。他供認自己是從瑙姆堡來的一位大學生。拿破崙豈不及待地想知道這個受過良好教育的青年為什麽這麽幹，他急切地問道：“你為什麽要殺我？""因為你毀滅了我的國家。""我傷害了你嗎？""同對所有德國人的傷害一樣。""你是第一次見到我嗎？""我在愛爾富特見過你，你同俄國皇帝會晤的時候。""那時候你想殺我嗎？""不，我以為你不會再對我們的國家進行戰爭。我曾對你萬分崇拜。一星期前我來到肖恩布魯恩，目的是殺死你。可我到達時，閱兵式剛剛結束。所以，我推遲到今天來實行我的意圖。""在我的士兵中間殺死我，你打算怎樣逃跑？”“我知道麵臨的是怎樣的危險，我甚至吃驚自己還活著。"拿破崙被青年人這種鎮定的態度觸動了，他沉默片刻後，又把目光落在年輕人的身上，年輕人在他的逼視下仍然泰然自若。拿破崙繼續問道：”如果我現在馬上把你釋放了，你將去做什麽呢？""我還會伺機幹掉你的。"拿破崙又一次沉默了。隨後他自言自語道：“這個青年人不是有病，便是個瘋子。”
第二天，拿破崙召來同奧地利談判的大臣特。香巴尼先生，"談判進行得怎樣了？"他問道。香巴尼說談判已經擱置，拿破崙接著說：“我希望馬上恢復談判。我希望為了和平，不要為奧地利的賠款少幾百萬而猶豫不決，在那點上讓步。我希望有個結局，我完全交給你辦了。"香巴尼立即執行拿破崙的命令。當晚，雙方談判代表開始討論擱置起來的和約條文。