不過 塞特人畢竟是銀河霸主，盡管受到重創，但其剩餘實力仍不在人類之下。在發現麵臨強勁對手後，就迅速的收縮防線，放棄大量殖民星係以爭取時間，在人類的第一次攻擊結束後不久，便完成了戰略調整和準備，發動了反攻。幸好人類也是早有準備，並沒有將力量用盡，加上新歸附的大量抵抗組織，與塞特人在各個戰區展開了激戰，空前激烈的銀河爭霸戰很快進入戰略相持階段。
四百多年後，經過聯邦科學院上下科研人員的長期攻關，終於在西摩人的基礎上研製成功了針對塞特人的基因武器。除了大量裝備前線部隊外，還大批的運往帝國內部，交給那些抵抗組織，當年西摩人的悲劇開始重演了，勝利的天平開始向人類傾斜。
由於人類聯軍和他們支持的抵抗組織在塞特帝國內外大量使用這種被稱為“陽光”的基因武器，一百多年後，塞特人中的絕大部分人都已悲慘的死去，殘餘的塞特人雖然盡力的防護和不斷採取新的醫療手段，但仍跟不上人類基因武器的更新速度。再也無法抵擋人類越來越猛烈的攻勢，當塞特人被壓迫到不足一百個星係的範圍後，完全絕望的塞特人開始了瘋狂的最後反攻。並將極少數沒被感染的戰士和病情較輕的人組織起來，趁人類軍隊忙於應付反攻無暇兼顧時，避開防禦銀盤的人類軍隊，冒險進入充滿危險的銀暈。艦隊攜帶著還不成熟的人類基因武器和塞特人威力最大的武器向太陽聯邦首都太陽係攻來。
盟軍統帥部早已預料到可能會出現這種情況，西摩人當年就是用這種戰術對塞特帝國造成了重大傷亡，早就嚴陣以待。塞特人的艦隊還未離開銀暈就已經被發現了。太陽聯邦一邊調動所有軍事手段進行攔截，一邊啟動了緊急方案。兩萬多位科學院院士和大批人類精英立即疏散到了其他星係，同時，聯邦的超級智腦“太陽神”也於四千多光年外的另一台同型智腦建立了超空連接，將聯邦的核心機密和科學資料全部轉移。這樣做原本是為了保護人類精英和科技，以免造成損失。但令批準這個計劃的聖殿沒有想到的是，剛剛成為銀河霸主的太陽聯邦就毀在這個計劃上。
對塞特艦隊的攔截非常成功，聯邦的九支一極艦隊和十二支二極艦隊從距太陽係兩千光年外就開始阻擊塞特艦隊，加上阻擊時間中陸續趕來的其他艦隊。越接近太陽係，人類的防禦力量就越強大。結果還沒等到塞特艦隊接近太陽係，整個艦隊就全軍覆滅了。盡管人類付出了比塞特人更大的代價，但卻使塞特人這垂死一擊沒有得到任何實質性的收穫，不久，人類聯軍就攻占了塞特星區。
銀河爭霸大戰從開始到結束，共持續了地球時間五百七十四年，以人類為主的太陽聯邦在其他十一個強大種族幫助下，終於徹底消滅了塞特帝國。在這場銀河係有史以來最慘烈的戰爭中笑到了最後。
盡管人類贏得了戰爭的最後勝利，但在勝利背後所付出的代價也是極為慘重的。聯邦人口從戰前的七百六十三億下降到了五百四十一億。一百三十二個殖民星係被徹底毀滅，兩千多個殖民星受到嚴重破壞。雖然代價如此巨大，人類畢竟還是勝利了。所獲得的利益也是空前巨大的。短時間內在銀河係已不可能出現挑戰人類地位的種族。可就在這絕大部分人都以為可以安享太平的時候，又一場比銀河爭霸戰更可怕，更殘酷的戰爭開始了。
銀河戰爭結束後不到兩年，位於人馬臂的因魯克人宣布獨立，並對駐紮在附近的聯邦第十七軍團發動突襲，十七軍團司令崗列上將報稱受到毀滅性打擊。請求聯邦軍事委員會盡快調集大軍平定叛亂。
因魯克人是人類在銀河戰爭中最重要的盟友，也是實力最雄厚的一個。為了爭取因魯克人加入盟軍，太陽聯邦主席莫克曾向他們承諾，如果他們站到人類這一邊來，戰爭勝利後將他們國境附近的六十七個星係劃歸他們管理。戰爭結束後，聯邦政府立刻兌現了自己的承諾。但也因此讓因魯克人的實力急劇擴張，成為銀河係中除了人類以外最強大的種族。聯邦為了防備因魯克人生出異心，就在附近星區部署了兩支一級艦隊和六支二級艦隊，以震懾因魯克人對控製範圍以外的野心。
因魯克人的攻擊立即震動了正在忙於整頓征服星係的聯邦政府。為了避免連鎖反應，政府和聖殿一致決定，必須盡快將這次叛亂鎮壓下去，否則會對聯邦目前已經十分混亂的局勢急劇惡化。力爭在最短的時間內打敗因魯克人。但是為了穩定銀河的形勢，元氣大傷的聯邦軍隊還不得不在每一個星球派遣安全部隊。若想調集足夠超過因魯克人的軍事實力，根本做不到。從那裏抽取軍隊，那裏就會出現力量真空狀態。
後來、聯邦副主席伯頓提議，從首都星係和附近的二十一個星區調用軍隊平叛，這一帶是人類的老根據地，根本沒有足以威脅人類的種族。主要軍事力量被調走後，也不至於出現什麽亂子。聖殿和政府在經過研究後，批準了這一提案。
隻有極少數人感覺到了這個計劃的危險性，金陽和莫平就是其中兩人。不少人雖然提出了不少折衷意見，但是沒有改變政府和聖殿的決定。但當時誰也沒想到，這一切、竟是一個人類有史以來最惡毒的計劃。
製訂這個惡毒計劃的就是聯邦第一副主席伯頓。當時沒有任何人會想到，備受聖祖尼瑪寵愛的伯頓會在這個時候選擇顛覆聯邦。在尼瑪的全力扶持下，他已經可以有絕對的把握可以繼任莫克成為下一任聯邦主席了。可是、伯頓不想要一個有太上皇的民選國家，即使是統一銀河後空前強大的太陽聯邦。
四百多年後，經過聯邦科學院上下科研人員的長期攻關，終於在西摩人的基礎上研製成功了針對塞特人的基因武器。除了大量裝備前線部隊外，還大批的運往帝國內部，交給那些抵抗組織，當年西摩人的悲劇開始重演了，勝利的天平開始向人類傾斜。
由於人類聯軍和他們支持的抵抗組織在塞特帝國內外大量使用這種被稱為“陽光”的基因武器，一百多年後，塞特人中的絕大部分人都已悲慘的死去，殘餘的塞特人雖然盡力的防護和不斷採取新的醫療手段，但仍跟不上人類基因武器的更新速度。再也無法抵擋人類越來越猛烈的攻勢，當塞特人被壓迫到不足一百個星係的範圍後，完全絕望的塞特人開始了瘋狂的最後反攻。並將極少數沒被感染的戰士和病情較輕的人組織起來，趁人類軍隊忙於應付反攻無暇兼顧時，避開防禦銀盤的人類軍隊，冒險進入充滿危險的銀暈。艦隊攜帶著還不成熟的人類基因武器和塞特人威力最大的武器向太陽聯邦首都太陽係攻來。
盟軍統帥部早已預料到可能會出現這種情況，西摩人當年就是用這種戰術對塞特帝國造成了重大傷亡，早就嚴陣以待。塞特人的艦隊還未離開銀暈就已經被發現了。太陽聯邦一邊調動所有軍事手段進行攔截，一邊啟動了緊急方案。兩萬多位科學院院士和大批人類精英立即疏散到了其他星係，同時，聯邦的超級智腦“太陽神”也於四千多光年外的另一台同型智腦建立了超空連接，將聯邦的核心機密和科學資料全部轉移。這樣做原本是為了保護人類精英和科技，以免造成損失。但令批準這個計劃的聖殿沒有想到的是，剛剛成為銀河霸主的太陽聯邦就毀在這個計劃上。
對塞特艦隊的攔截非常成功，聯邦的九支一極艦隊和十二支二極艦隊從距太陽係兩千光年外就開始阻擊塞特艦隊，加上阻擊時間中陸續趕來的其他艦隊。越接近太陽係，人類的防禦力量就越強大。結果還沒等到塞特艦隊接近太陽係，整個艦隊就全軍覆滅了。盡管人類付出了比塞特人更大的代價，但卻使塞特人這垂死一擊沒有得到任何實質性的收穫，不久，人類聯軍就攻占了塞特星區。
銀河爭霸大戰從開始到結束，共持續了地球時間五百七十四年，以人類為主的太陽聯邦在其他十一個強大種族幫助下，終於徹底消滅了塞特帝國。在這場銀河係有史以來最慘烈的戰爭中笑到了最後。
盡管人類贏得了戰爭的最後勝利，但在勝利背後所付出的代價也是極為慘重的。聯邦人口從戰前的七百六十三億下降到了五百四十一億。一百三十二個殖民星係被徹底毀滅，兩千多個殖民星受到嚴重破壞。雖然代價如此巨大，人類畢竟還是勝利了。所獲得的利益也是空前巨大的。短時間內在銀河係已不可能出現挑戰人類地位的種族。可就在這絕大部分人都以為可以安享太平的時候，又一場比銀河爭霸戰更可怕，更殘酷的戰爭開始了。
銀河戰爭結束後不到兩年，位於人馬臂的因魯克人宣布獨立，並對駐紮在附近的聯邦第十七軍團發動突襲，十七軍團司令崗列上將報稱受到毀滅性打擊。請求聯邦軍事委員會盡快調集大軍平定叛亂。
因魯克人是人類在銀河戰爭中最重要的盟友，也是實力最雄厚的一個。為了爭取因魯克人加入盟軍，太陽聯邦主席莫克曾向他們承諾，如果他們站到人類這一邊來，戰爭勝利後將他們國境附近的六十七個星係劃歸他們管理。戰爭結束後，聯邦政府立刻兌現了自己的承諾。但也因此讓因魯克人的實力急劇擴張，成為銀河係中除了人類以外最強大的種族。聯邦為了防備因魯克人生出異心，就在附近星區部署了兩支一級艦隊和六支二級艦隊，以震懾因魯克人對控製範圍以外的野心。
因魯克人的攻擊立即震動了正在忙於整頓征服星係的聯邦政府。為了避免連鎖反應，政府和聖殿一致決定，必須盡快將這次叛亂鎮壓下去，否則會對聯邦目前已經十分混亂的局勢急劇惡化。力爭在最短的時間內打敗因魯克人。但是為了穩定銀河的形勢，元氣大傷的聯邦軍隊還不得不在每一個星球派遣安全部隊。若想調集足夠超過因魯克人的軍事實力，根本做不到。從那裏抽取軍隊，那裏就會出現力量真空狀態。
後來、聯邦副主席伯頓提議，從首都星係和附近的二十一個星區調用軍隊平叛，這一帶是人類的老根據地，根本沒有足以威脅人類的種族。主要軍事力量被調走後，也不至於出現什麽亂子。聖殿和政府在經過研究後，批準了這一提案。
隻有極少數人感覺到了這個計劃的危險性，金陽和莫平就是其中兩人。不少人雖然提出了不少折衷意見，但是沒有改變政府和聖殿的決定。但當時誰也沒想到，這一切、竟是一個人類有史以來最惡毒的計劃。
製訂這個惡毒計劃的就是聯邦第一副主席伯頓。當時沒有任何人會想到，備受聖祖尼瑪寵愛的伯頓會在這個時候選擇顛覆聯邦。在尼瑪的全力扶持下，他已經可以有絕對的把握可以繼任莫克成為下一任聯邦主席了。可是、伯頓不想要一個有太上皇的民選國家，即使是統一銀河後空前強大的太陽聯邦。