當時，“赤城號”的位置比山本的主力靠前得多，但它對美軍的活動和意圖也所知甚少。其實，南雲比山本更是蒙在鼓裏。南雲的航空母艦上無線電接收機功率比山本的小，加上要保持無線電靜默，因而，宇垣和三和已經注意到的情報──清楚地表明美太平洋艦隊已經探到一點風聲，南雲卻並不知道。
南雲的參謀長草鹿一開始就擔心會出現這種不能與山本交流情報的情況，甚至早在出發前，他就一再催促山本向“赤城號”轉發聯合艦隊司令部收到的所有情報。 [ 註：同上，第123—124頁。 ] 然而，哪些情報重要，哪些不重要，顯然沒有說明。隻重視水麵作戰，以戰列艦為中心的主力艦隊認為價值不大甚至毫無價值的情報，對南雲的航空母艦艦隊的航空兵倒可能是千金難買的寶貝。
除對情報的價值認識不同外， 日本這次出海遠征的規模太大也引起了一些混亂。例如，大約就在這時，海軍軍令部用無線電通知“大和號”：中途島以東海域美航空母艦艦隊“很可能”正在動作，也許正在準備設埋伏。這一電報將第一航空艦隊也列入了收報單位。山本看過電報，對黑島說：“我看最好以山本或聯合艦隊的名義將這份電報轉發給南雲。”但黑島卻說：“既然第一航空艦隊也是收報單位，就沒有必要由聯合艦隊向南雲轉發了。何況現在還保持著無線電靜默。我們還是不應打破它。” [ 註：對黑島的採訪，1964年11月28日。 ]
美國人這邊也有通訊聯絡的問題。斯普魯恩斯的無線電員報告說，他們聽到了瓦胡島外的沿海巡邏隊與珍珠港的通話。這一情況令人不安，說明tbs係統並不能抗竊聽。tbs係統是短距離直線傳播係統，原估計它的電波不會越出地平線。這次通話傳到第十六特棍艦隊上也許是大氣或力學上的反常現象。這種反常現象可能數周或數年也不會出現一次，但斯普魯恩斯還是不想冒險。他用目視信號通令全特混艦隊：除非情況極為緊急，夜間不得使用tbs係統，白天隻準使用目視信號。斯普魯恩斯決心不喪失作戰的突然性，也決不暴露自己的位置。因此，在下令禁止使用無線電的同時，他通知所有飛行員，在即將開始的戰役中，各機自行返回航空母艦，不能再指望航空母艦用無線電導航。 [ 註：對斯普魯恩斯的採訪，1965年9月5日；《斯普魯恩斯》，第39頁。 ]
這天，夏威夷時間6月1日，日本報紙早就說已經沉沒了的“薩拉托加號”航空母艦全速離開了聖迭戈，希望能及時趕到中途島海區參加戰鬥。結果卻未能如願，它到達珍珠港那天，中途島海戰已告結束。參戰部隊方麵，弗萊徹的第十七特混艦隊接受了“西馬倫號”和“普拉特號”戰前的最後一次加油，同時，“大黃蜂號”派飛機飛出150海裏進行搜索，但沒有發現敵人。 [ 註：“中途島海戰分析”，第63頁；《珊瑚海海戰、中途島海戰及潛艇作戰》，第156—157頁；“大黃蜂號”和“企業號”航海日誌，1942年6月1日。 ]
“這鬼天氣又冷又潮，因此，很可能最先發出有關日軍消息的是中途島的雷達。”在vf-6的飛行日誌上說， [ 註：vf-6非正式飛行日誌，1942年6月2日。 ] 第二天依然是濃雲密布、波浪滔天，美日雙方艦隊的前進均受到阻礙。南雲的艦隻在600碼距離以外就相互視而不見。為避免相撞並保持隊形，南雲批準使用探照燈。這一舉動相當冒險，但是濃霧像一堵厚厚的牆，強大的光柱幾乎未離開燈座就彌散開來，根本無法穿透。濃霧使南雲不能派出反潛巡邏飛機，但對裝備著雷達的美軍潛艇卻不起作用。於是，南雲命令艦隊高度戒備，並加派雙哨加強對敵潛艇的觀察和警戒。 [ 註：《中途島海戰》，第123—124頁。 ]
南雲及其參謀們聚集在“赤城號”艦橋的右邊，默不作聲地注視著前方。艦橋左邊，艦長青木和航海長三浦海軍中佐在能見度幾乎為零的困難情況下聚精會神地指揮軍艦保持隊形和航向。按照原定計劃，艦空母艦機動部隊應於10時30分改變艦向，這對南雲可是個大難題，他必須通知所有艦隻按原計劃改變航向。但是濃霧瀰漫，旗號聯絡已毫無用處，探照燈光也不能有效地傳遞命令。唯一的辦法是使用無線電，但那樣做就等於把機動部隊的位置通知美方。 [ 註：《中途島海戰》，第126頁；日本的敘述，第6頁。 ]
南雲不喜歡使用這些辦法。他本人驍勇無比，連戰連捷又使他趾高氣揚，雄心勃勃。但是，他總喜歡不折不扣地按照上級的規定作戰，而缺少在情況發生變化時相應地迅速作出決斷的靈活性。然而，這時，他處於並非是自己造成的困境之中。中途島作戰賦予他的兩項任務互相矛盾。它們分別要求他以根本不同的方法行事，就像在橄欖球比賽中，他既要保護帶球者以防對方搶球，又要自己帶球突破。他的一個任務是：航空母艦機動部隊須先於近藤的艦隊到達中途島，對島實施火力攻擊，為登陸鋪平道路。這一任務要求南雲必須在某一時間處於某一地點，即處於球門(中途島)與帶球隊員(近藤)之間。中途島和近藤都不會為了方便南雲而移動位置。這樣，南雲必須保持既定航向。然而，他的第二個任務卻是獨立自主的：如果美太平洋艦隊出動迎戰，南雲鬚協助攻擊並將其摧毀。這一任務要求高度的戰術機動並保守行蹤的秘密。這兩個任務隻有在一個前提下才能統一起來，那就是，尼米茲不折不扣地按照日方計劃行事，聽到中途島受到攻擊時才命令艦隊出動。
南雲的參謀長草鹿一開始就擔心會出現這種不能與山本交流情報的情況，甚至早在出發前，他就一再催促山本向“赤城號”轉發聯合艦隊司令部收到的所有情報。 [ 註：同上，第123—124頁。 ] 然而，哪些情報重要，哪些不重要，顯然沒有說明。隻重視水麵作戰，以戰列艦為中心的主力艦隊認為價值不大甚至毫無價值的情報，對南雲的航空母艦艦隊的航空兵倒可能是千金難買的寶貝。
除對情報的價值認識不同外， 日本這次出海遠征的規模太大也引起了一些混亂。例如，大約就在這時，海軍軍令部用無線電通知“大和號”：中途島以東海域美航空母艦艦隊“很可能”正在動作，也許正在準備設埋伏。這一電報將第一航空艦隊也列入了收報單位。山本看過電報，對黑島說：“我看最好以山本或聯合艦隊的名義將這份電報轉發給南雲。”但黑島卻說：“既然第一航空艦隊也是收報單位，就沒有必要由聯合艦隊向南雲轉發了。何況現在還保持著無線電靜默。我們還是不應打破它。” [ 註：對黑島的採訪，1964年11月28日。 ]
美國人這邊也有通訊聯絡的問題。斯普魯恩斯的無線電員報告說，他們聽到了瓦胡島外的沿海巡邏隊與珍珠港的通話。這一情況令人不安，說明tbs係統並不能抗竊聽。tbs係統是短距離直線傳播係統，原估計它的電波不會越出地平線。這次通話傳到第十六特棍艦隊上也許是大氣或力學上的反常現象。這種反常現象可能數周或數年也不會出現一次，但斯普魯恩斯還是不想冒險。他用目視信號通令全特混艦隊：除非情況極為緊急，夜間不得使用tbs係統，白天隻準使用目視信號。斯普魯恩斯決心不喪失作戰的突然性，也決不暴露自己的位置。因此，在下令禁止使用無線電的同時，他通知所有飛行員，在即將開始的戰役中，各機自行返回航空母艦，不能再指望航空母艦用無線電導航。 [ 註：對斯普魯恩斯的採訪，1965年9月5日；《斯普魯恩斯》，第39頁。 ]
這天，夏威夷時間6月1日，日本報紙早就說已經沉沒了的“薩拉托加號”航空母艦全速離開了聖迭戈，希望能及時趕到中途島海區參加戰鬥。結果卻未能如願，它到達珍珠港那天，中途島海戰已告結束。參戰部隊方麵，弗萊徹的第十七特混艦隊接受了“西馬倫號”和“普拉特號”戰前的最後一次加油，同時，“大黃蜂號”派飛機飛出150海裏進行搜索，但沒有發現敵人。 [ 註：“中途島海戰分析”，第63頁；《珊瑚海海戰、中途島海戰及潛艇作戰》，第156—157頁；“大黃蜂號”和“企業號”航海日誌，1942年6月1日。 ]
“這鬼天氣又冷又潮，因此，很可能最先發出有關日軍消息的是中途島的雷達。”在vf-6的飛行日誌上說， [ 註：vf-6非正式飛行日誌，1942年6月2日。 ] 第二天依然是濃雲密布、波浪滔天，美日雙方艦隊的前進均受到阻礙。南雲的艦隻在600碼距離以外就相互視而不見。為避免相撞並保持隊形，南雲批準使用探照燈。這一舉動相當冒險，但是濃霧像一堵厚厚的牆，強大的光柱幾乎未離開燈座就彌散開來，根本無法穿透。濃霧使南雲不能派出反潛巡邏飛機，但對裝備著雷達的美軍潛艇卻不起作用。於是，南雲命令艦隊高度戒備，並加派雙哨加強對敵潛艇的觀察和警戒。 [ 註：《中途島海戰》，第123—124頁。 ]
南雲及其參謀們聚集在“赤城號”艦橋的右邊，默不作聲地注視著前方。艦橋左邊，艦長青木和航海長三浦海軍中佐在能見度幾乎為零的困難情況下聚精會神地指揮軍艦保持隊形和航向。按照原定計劃，艦空母艦機動部隊應於10時30分改變艦向，這對南雲可是個大難題，他必須通知所有艦隻按原計劃改變航向。但是濃霧瀰漫，旗號聯絡已毫無用處，探照燈光也不能有效地傳遞命令。唯一的辦法是使用無線電，但那樣做就等於把機動部隊的位置通知美方。 [ 註：《中途島海戰》，第126頁；日本的敘述，第6頁。 ]
南雲不喜歡使用這些辦法。他本人驍勇無比，連戰連捷又使他趾高氣揚，雄心勃勃。但是，他總喜歡不折不扣地按照上級的規定作戰，而缺少在情況發生變化時相應地迅速作出決斷的靈活性。然而，這時，他處於並非是自己造成的困境之中。中途島作戰賦予他的兩項任務互相矛盾。它們分別要求他以根本不同的方法行事，就像在橄欖球比賽中，他既要保護帶球者以防對方搶球，又要自己帶球突破。他的一個任務是：航空母艦機動部隊須先於近藤的艦隊到達中途島，對島實施火力攻擊，為登陸鋪平道路。這一任務要求南雲必須在某一時間處於某一地點，即處於球門(中途島)與帶球隊員(近藤)之間。中途島和近藤都不會為了方便南雲而移動位置。這樣，南雲必須保持既定航向。然而，他的第二個任務卻是獨立自主的：如果美太平洋艦隊出動迎戰，南雲鬚協助攻擊並將其摧毀。這一任務要求高度的戰術機動並保守行蹤的秘密。這兩個任務隻有在一個前提下才能統一起來，那就是，尼米茲不折不扣地按照日方計劃行事，聽到中途島受到攻擊時才命令艦隊出動。