第一階段：聯合艦隊主力部隊將攻占中途島：一支機動部隊將攻占阿留申群島西部。此舉誘出美太平洋艦隊後，日軍隨即對其實施決定性打擊。使其在以後幾個月內不能成為一支主力。
第二階段：完成中途島—阿留申群島作戰任務後，大部分戰列艦將返回本土待命，其餘參加中途島作戰的部隊在特魯克集結，準備7月初進攻新喀裏多尼亞和斐濟群島。
第三階段：南雲的航空母艦部隊將空襲雪梨和澳大利亞東南部其他要地。
第四階段：南雲艦隊與新喀裏多尼亞—斐濟參戰部隊在特魯克會合，補充給養。8月初，聯合艦隊將以全部兵力攻打強斯頓環礁和夏威夷。 [ 註：《中途島海戰》，第95頁。 ]
龐大的圖上演習由宇垣主持，自始至終，他一直不切實際地盲目樂觀，態度強硬。他深信根本不會存在日本人不能完全控製的局勢。因此，他不允許出現任何可能嚴重影響演習順利達到預期結論的情況，他毫無顧忌地對其他演習裁判作出的不利裁決予以否定。 [ 註：同上，第96頁。 ]
山本已經調集200餘艘艦船參加這一大規模戰役，並確定6月7日為n日 [ 譯者註：n日即進攻日，相當於美軍的d日。 ] 。選擇這一天進攻可以使南雲和近藤兩支艦隊有充足的時間進行徹底檢修，同時，這一天又是在未來一個多月時間裏利用滿月進行夜戰的最後機會。 [ 註：《中途島海戰》，第79頁和84頁。 ] 按照計劃，n日前5天即6月2日，小鬆輝久海軍中將的先遣潛艇部隊將在中途島以東設置由3個部分組成的警戒線，以便偵察敵艦隊活動情況。第三潛艇戰隊(伊 -168、伊-169、伊-171、伊-174、伊-175)將部署在北緯19°30′—23°30′、西經167°一線；第五潛艇戰隊(伊-156、伊 -157、伊-158、伊-159、伊-162、伊-165、伊-166)將部署在北緯29°30′、西經164°30′至北緯26°10′、西經 167°一線，最後，第十三潛艇分隊(伊-121、伊-122、伊-123)將作為補給隊，向利相斯基島和弗倫奇弗裏蓋特沙洲運送汽油和柴油。 [ 註：同上，第89頁；對渡邊的採訪，1964年9月26日。 ]
按照海軍軍令部三代的計劃，這些潛艇還負責為兩架各重31噸、飛行距離為4000海裏的川西2式水上飛機加油的任務。這兩架飛機將從沃特傑環礁起飛，在弗倫奇弗裏蓋特沙洲接受潛艇加油，並對敵兵力及活動進行偵察。因為日本戰前在瓦胡島建立的出色的諜報機構已經痛失。在3月4日，已有兩架這種水上飛機飛抵珍珠港上空作摹擬投彈練習並投了幾顆炸彈，但完全是為了嚇唬對方。 [ 註：同上，第88頁；巴德對三代的採訪，1966年5月6日。 ]
盡管水下先遣任務極為重要，但潛艇部隊司令小鬆沒有親自參加演習。不過，他的全體參謀都參加了。在中途島作戰計劃的正式命令中隻字未提潛艇搜索任務。這類作戰命令中的潛艇部分通常是由山本的潛艇參謀有馬高泰海軍中佐負責起草的，但出於某種原因，黑島告訴他不必這樣做。 [ 註：對渡邊的採訪，1964年9月26日和10月6日。 ]
就位的下一支部隊是細萱戍四郎海軍中將的北方部隊。他們將於n日前3天即6月4日進攻阿留申群島。這支艦隊大得令人生畏。它轄有3艘重型巡洋艦、3艘輕型巡洋艦、1艘輔助巡洋艦、12艘驅逐艦、3艘掃雷艦、1艘布雷艦、3艘共載1200人的陸軍登陸隊和1250人的海軍登陸隊的運輸艦，還有2艘航空母艦──載有16架戰鬥機和21架魚雷轟炸機的“龍驤號”和搭載24架戰鬥機和21架俯衝轟炸機的“隼鷹號”。 [ 註：《中途島海戰》，第89—83頁。 ]
主攻方向是中途島。南雲的第一航空母艦突擊部隊將於n日前2天(6月5日)從中途島東北約250海裏處開始行動。任務是：清除攻擊範圍內所有敵水麵及空中部隊，摧毀中途島海岸設施。按原計劃，南雲將率領襲擊珍珠港時的6艘航空母艦，但由於“翔鶴號”和“瑞鶴號”仍在南太平洋作戰，能否趕回來還不知道，但他能指望“赤城號”、“加賀號”、“飛龍號”和“蒼龍號”4艘航空母艦投入中途島作戰。“赤城號”和“加賀號”共載42架戰鬥機、42架俯衝轟炸機、 51架魚雷轟炸機。“蒼龍號”和“飛龍號”也有同樣數目的戰鬥機和俯衝轟炸機，還有42架魚雷轟炸機。南雲的支援艦隻有戰列艦“榛名號”和“霧島號”、重巡洋艦“利根號”和“築摩號”、輕巡洋艦“長良號”，還有11艘驅逐艦。 [ 註：同上，第80—81、85，106頁。 ]
該計劃要求由水上飛機母艦“千歲號”和“神川丸”、1艘驅逐艦和1艘巡邏艇組成的藤田類太郎海軍少將的水上飛機母艦部隊於次日攻占中途島西北約60海裏的庫雷島。這樣，24架艦載戰鬥機和8架偵察機將以庫雷島為基地支援主力登陸。
根據演習中的計劃，從塞班島出發的由12艘運輸船和3艘快速運輸艦組成的田中賴三海軍少將的輸送船團將於同日(6月6日)與從本土向東稍偏南運動的近藤的中途島攻擊部隊主力相會合。 [ 註：《中途島海戰》，第86—86頁。 ] 為使美國人誤以為日軍主力來自南方，田中的船隊須在此時故意讓敵方發現。 [ 註：對渡邊的採訪，1964年9月26日。 ] 這就需要精確地計算時間：攻擊部隊既要被敵人發現，又不能過早暴露。
第二階段：完成中途島—阿留申群島作戰任務後，大部分戰列艦將返回本土待命，其餘參加中途島作戰的部隊在特魯克集結，準備7月初進攻新喀裏多尼亞和斐濟群島。
第三階段：南雲的航空母艦部隊將空襲雪梨和澳大利亞東南部其他要地。
第四階段：南雲艦隊與新喀裏多尼亞—斐濟參戰部隊在特魯克會合，補充給養。8月初，聯合艦隊將以全部兵力攻打強斯頓環礁和夏威夷。 [ 註：《中途島海戰》，第95頁。 ]
龐大的圖上演習由宇垣主持，自始至終，他一直不切實際地盲目樂觀，態度強硬。他深信根本不會存在日本人不能完全控製的局勢。因此，他不允許出現任何可能嚴重影響演習順利達到預期結論的情況，他毫無顧忌地對其他演習裁判作出的不利裁決予以否定。 [ 註：同上，第96頁。 ]
山本已經調集200餘艘艦船參加這一大規模戰役，並確定6月7日為n日 [ 譯者註：n日即進攻日，相當於美軍的d日。 ] 。選擇這一天進攻可以使南雲和近藤兩支艦隊有充足的時間進行徹底檢修，同時，這一天又是在未來一個多月時間裏利用滿月進行夜戰的最後機會。 [ 註：《中途島海戰》，第79頁和84頁。 ] 按照計劃，n日前5天即6月2日，小鬆輝久海軍中將的先遣潛艇部隊將在中途島以東設置由3個部分組成的警戒線，以便偵察敵艦隊活動情況。第三潛艇戰隊(伊 -168、伊-169、伊-171、伊-174、伊-175)將部署在北緯19°30′—23°30′、西經167°一線；第五潛艇戰隊(伊-156、伊 -157、伊-158、伊-159、伊-162、伊-165、伊-166)將部署在北緯29°30′、西經164°30′至北緯26°10′、西經 167°一線，最後，第十三潛艇分隊(伊-121、伊-122、伊-123)將作為補給隊，向利相斯基島和弗倫奇弗裏蓋特沙洲運送汽油和柴油。 [ 註：同上，第89頁；對渡邊的採訪，1964年9月26日。 ]
按照海軍軍令部三代的計劃，這些潛艇還負責為兩架各重31噸、飛行距離為4000海裏的川西2式水上飛機加油的任務。這兩架飛機將從沃特傑環礁起飛，在弗倫奇弗裏蓋特沙洲接受潛艇加油，並對敵兵力及活動進行偵察。因為日本戰前在瓦胡島建立的出色的諜報機構已經痛失。在3月4日，已有兩架這種水上飛機飛抵珍珠港上空作摹擬投彈練習並投了幾顆炸彈，但完全是為了嚇唬對方。 [ 註：同上，第88頁；巴德對三代的採訪，1966年5月6日。 ]
盡管水下先遣任務極為重要，但潛艇部隊司令小鬆沒有親自參加演習。不過，他的全體參謀都參加了。在中途島作戰計劃的正式命令中隻字未提潛艇搜索任務。這類作戰命令中的潛艇部分通常是由山本的潛艇參謀有馬高泰海軍中佐負責起草的，但出於某種原因，黑島告訴他不必這樣做。 [ 註：對渡邊的採訪，1964年9月26日和10月6日。 ]
就位的下一支部隊是細萱戍四郎海軍中將的北方部隊。他們將於n日前3天即6月4日進攻阿留申群島。這支艦隊大得令人生畏。它轄有3艘重型巡洋艦、3艘輕型巡洋艦、1艘輔助巡洋艦、12艘驅逐艦、3艘掃雷艦、1艘布雷艦、3艘共載1200人的陸軍登陸隊和1250人的海軍登陸隊的運輸艦，還有2艘航空母艦──載有16架戰鬥機和21架魚雷轟炸機的“龍驤號”和搭載24架戰鬥機和21架俯衝轟炸機的“隼鷹號”。 [ 註：《中途島海戰》，第89—83頁。 ]
主攻方向是中途島。南雲的第一航空母艦突擊部隊將於n日前2天(6月5日)從中途島東北約250海裏處開始行動。任務是：清除攻擊範圍內所有敵水麵及空中部隊，摧毀中途島海岸設施。按原計劃，南雲將率領襲擊珍珠港時的6艘航空母艦，但由於“翔鶴號”和“瑞鶴號”仍在南太平洋作戰，能否趕回來還不知道，但他能指望“赤城號”、“加賀號”、“飛龍號”和“蒼龍號”4艘航空母艦投入中途島作戰。“赤城號”和“加賀號”共載42架戰鬥機、42架俯衝轟炸機、 51架魚雷轟炸機。“蒼龍號”和“飛龍號”也有同樣數目的戰鬥機和俯衝轟炸機，還有42架魚雷轟炸機。南雲的支援艦隻有戰列艦“榛名號”和“霧島號”、重巡洋艦“利根號”和“築摩號”、輕巡洋艦“長良號”，還有11艘驅逐艦。 [ 註：同上，第80—81、85，106頁。 ]
該計劃要求由水上飛機母艦“千歲號”和“神川丸”、1艘驅逐艦和1艘巡邏艇組成的藤田類太郎海軍少將的水上飛機母艦部隊於次日攻占中途島西北約60海裏的庫雷島。這樣，24架艦載戰鬥機和8架偵察機將以庫雷島為基地支援主力登陸。
根據演習中的計劃，從塞班島出發的由12艘運輸船和3艘快速運輸艦組成的田中賴三海軍少將的輸送船團將於同日(6月6日)與從本土向東稍偏南運動的近藤的中途島攻擊部隊主力相會合。 [ 註：《中途島海戰》，第86—86頁。 ] 為使美國人誤以為日軍主力來自南方，田中的船隊須在此時故意讓敵方發現。 [ 註：對渡邊的採訪，1964年9月26日。 ] 這就需要精確地計算時間：攻擊部隊既要被敵人發現，又不能過早暴露。