馬燧，字洵美，汝州郟城縣人，祖籍扶風郡，唐朝中期名將，嵐州刺史馬季龍之子。出身扶風馬氏，少時博覽群書，攻讀兵法戰策，頗多謀略。安史之亂時，力勸範陽留守賈循倒戈，事泄逃脫，曆任趙城縣尉、左武衛兵曹參軍，出任河陽三城節度使，遷河東節度使。奉詔討魏博叛將田悅，誅殺田悅部將楊朝光，大破田悅於臨洺，率軍連敗李懷光，平定河中府，抵禦吐蕃寇邊。平涼劫盟之後，失去兵權，授司徒兼侍中，隨太尉李晟繪像於淩煙閣。馬燧病逝，獲贈太尉，諡號“莊武”。
馬燧，祖先從扶風郡遷來汝州，祖父馬瑉，官至左玉鈐衛倉曹；父親馬季龍，曾中舉明兵法科，豪爽擅長兵法，官至嵐州刺史、幽州經略軍使。馬燧早年時，有次和幾個哥哥讀書，放下書歎氣說：“國家將有難了，英雄應立功於世，平定天下，怎能辛辛苦苦當儒生呢！”馬燧儀表風度傑出，身長六尺二寸，沉著勇敢多智謀，博覽各種書籍，尤其擅長兵法。
安史之亂爆發，派光祿卿賈循守範陽，馬燧勸賈循說：“安祿山背恩反叛，雖然攻陷了洛陽，定將被消滅。您為什麽不建稀世功勳呢？殺死他的將領向潤客、牛廷玠，抄他的老窩。安祿山向西不能打進關中，就會困在那裏被抓住，天下就可以平定了。”賈循雖讚同這話，但未乘機定計，事情泄露了，安祿山派韓朝陽來請賈循。韓朝陽到了範陽，和賈循談話，暗地埋伏武士用弓弦勒死了他，馬燧逃出跑到西山，隱士徐遇把他藏了起來。一個月後，馬燧從小路來到平原郡，平原郡失守後，他又逃到魏郡。
澤潞節度使李抱玉任命他為趙城縣尉，這時回紇大軍歸國，倚仗幫助收複洛陽的功勞，胡作非為，有時擄掠路過處的倉庫糧食，供應飯食稍不滿意，隨便殺人。李抱玉準備了供給品，下屬都不敢去送，馬燧自薦請求主持驛館事務，等回紇軍來了，就先給主帥送禮，和他約定紀律，回紇軍就授給馬燧令旗做標誌，命馬燧殺死違令者。馬燧用死刑犯人在身邊侍侯，稍不聽令，就殺死他們，回紇兵看了害怕，軍隊從這裏走過，沒有人敢侵害擄掠，李抱玉更加賞識他。
馬燧就勸李抱玉說：“近來和回紇人談話，我了解了他們的情況，現仆固懷恩倚功結黨，李懷仙、張忠誌、薛嵩、田承嗣分守各地，都是仆固懷恩的主意，他的兒子仆固瑒佻勇不義，依我看來，一定會侵占太原、西山叛亂，您應多做準備。”不久，仆固懷恩果然和太原都將李竭誠同謀，想奪取太原，主帥辛雲京察覺了這事，殺了李謁誠，守城自衛，仆固懷恩派他的兒子仆固瑒領兵包圍了太原。
當初，回紇軍北行歸國，派他們的將領安恪、石常庭領兵幾百名和招募投靠的幾千人守河陽，從洛陽搶來的珍寶，都存放在河陽。這時，仆固懷恩派薛嵩從相州、衛州送糧並切斷黃河渡口，李抱玉命馬燧到薛嵩處勸說，薛嵩就和仆固懷恩斷絕了關係聽從朝廷。朝廷於是任命馬燧為左武衛兵曹。
馬燧此後曆任太子通事舍人、著作郎、營田判官。不久後，又升任秘書少監、兼任殿中侍禦史，改任節度判官、承務郎，升任鄭州刺史，他勉勵督促農耕，統計戶數，每年收稅一次，人們都認為方便。馬燧改任懷州刺史，懷州遭遇兵荒之後，適逢當年發生夏旱，人們不能種莊稼，馬燧努力改善政務，將領官吏有父母的，馬燧就登門問候，安葬野地未埋的屍骨，減輕賦稅。到秋天，州內長出了野穀子，百姓多半靠這度災。
李抱玉移任駐守鳳翔，因汧陽有邊患，任命馬燧為隴州刺史、兼任禦史中丞。隴州西部有條路，寬兩百多步，上通高山，山和吐蕃相對，吐蕃每次入侵，都從這裏出來。馬燧巡視地形，壘石栽樹堵住這路，下麵修了兩處門，又修有望樓，八天就修成了。碰到李抱玉入朝，就和馬燧一同前往，很久以後，唐代宗聞知了馬燧的能幹，召見了他，封為商州刺史，兼任禦史中丞、防禦水陸運使。河陽三城兵變，趕走了節度使常休明，朝廷於是任命馬燧為檢校左散騎常侍、禦史大夫、河陽三城節度使。
汴州大將李靈耀反叛，占據州城，切斷漕運，求封節度使，代宗寬大為懷，任命李靈耀為汴州、宋州等八州節度留後。李靈耀不接受任命，於是暗地勾結魏博節度使田承嗣；田承嗣就派他侄子田悅率兵支援李靈耀，打敗了永平軍大將劉洽。代宗下詔馬燧和淮西節度使李忠臣會合討平李靈耀，李忠臣怕叛軍，焚燒營帳往西跑。馬燧勸他回軍，請求擔任先鋒，打敗了田悅，逼近汴州。李忠臣沿汴河南岸進軍，馬燧沿汴河北岸進軍，又在西梁固打敗了李靈耀的將領張清。
李靈耀選精兵八千，號稱“餓糧軍”，馬燧單獨率軍打敗了它，進抵浚儀。當時，河陽軍是諸軍中最強的。田承嗣於是又派田悅率兵兩萬援救李靈耀，打敗了永平軍將領杜如江，進犯曹州，又打敗李正己的遊軍，擊潰了劉洽、長孫全緒等人的軍隊，乘勝進到離汴州三十裏處，列陣前進。李忠臣會合宋州、淮南、浙西的軍隊，與田悅作戰不勝，向馬燧求救，馬燧帶四千兵出其不意擊敗了田悅，田悅單人匹馬逃走。李靈耀知道田悅戰敗後，第二天率一百名騎兵逃跑，汴州就投降了，馬燧把功勞讓給李忠臣。李忠臣生性暴躁，馬燧不想進汴州城，就帶兵到板橋紮營，李忠臣進城後，果然獨吞功勞，利用機會殺了宋州刺史李僧惠，馬燧於是回到了河陽。
馬燧任檢校工部尚書、太原尹、北都留守、河東節度留後，不久被任命為河東節度使，太原自前任節度使鮑防在百井戰敗後，軍隊弱小，馬燧就召集全部將領官吏的仆役，得到幾千人，都補充為騎兵，訓練了幾個月，成了精銳的騎兵。他命令製鎧甲一定按長短分三等，和士兵衣裳相當，以便行動，又製造軍車，蒙上畫有狻猊圖案的皮革，車後安有戟，行軍時裝運兵器鎧甲，宿營時列成營陣，有時堵在險要處阻擋敵軍進攻，軍械都十分犀利。過了一年，集中三萬軍隊，在校場上練習戰陣，教他們進退攻守的戰術。馬燧到京城朝見，升任檢校兵部尚書，朝廷命他回鎮太原。
魏博節度使田悅接替田承嗣帶兵，怕部將不歸附自己，假裝歸順，馬燧奏本揭露他一定會反叛，應先防備他。這年，田悅果然和淄青節度使李正己、成德節度使李惟嶽合謀反叛，親自率兵三萬包圍了邢州，自己到臨洺，築兩重城牆，隔絕內外，阻擋救兵。邢州守將李洪、臨洺守將張伾，都固守沒被攻破。昭義軍向朝廷求救，德宗急忙下詔命馬燧率步、騎兵兩萬人馬和昭義軍節度使李抱真、神策軍行營兵馬使李晟會合援救臨洺。馬燧軍從山郭口經過，軍隊沒通過險要地時，就派人送信告訴田悅，並表示友好，田悅認為馬燧畏懼自己。
馬燧率軍抵達邯鄲，田悅派使者來，馬燧將其斬殺，並派兵擊潰了田悅的一支部隊，射死魏博將領成炫之。田悅自己進攻臨洺，派大將楊朝光率兵萬名，在臨洺南邊雙岡東西並列兩個營寨抵禦馬燧。馬燧就率李抱真、李晟進軍，在兩座營寨之間紮營，這天夜裏東邊營寨兵馬逃回田悅處。第二天，馬燧進軍到明山紮營，占據被拋棄的營寨放置軍需品，田悅對部下說：“楊朝光堅守營寨的兵不少於一萬人，即使馬燧等用全部精兵攻他，幾天內，估計攻不下來。死傷一定很重。我這裏一定攻下了臨洺，犒勞兵將再和他們作戰，這是必贏的部署。”
田悅於是派恒州李惟嶽的援軍五千增援楊朝光，馬燧帶兵進攻楊朝光，田悅又帶一萬多軍隊增援他，馬燧就命大將李自良、李奉國率騎兵會同神策軍在雙岡抵禦，下令道：“讓田悅過來了，就殺了你們！”李自良等擊退了田悅。馬燧就命推出燃火車燒楊朝光的營寨，殺死了楊朝光和大將盧子昌，斬首五千餘級，活捉八百多人，停留五天，推進到臨洺，田悅率全軍來會戰。馬燧親自率領精兵抵擋前鋒，接戰一百多次，士兵都死戰，田悅軍大敗，斬首一萬餘級，活捉九百人，繳獲糧食三十萬斛，器械鎧甲與這相當。田悅召集敗兵夜裏逃走了，對邢州的包圍也解除了，因功勞升任右仆射。
戰前，馬燧對兵將起誓，戰勝後用私財行賞。戰勝後，馬燧拿出所有家財獎賞兵將，德宗稱讚他，下詔拿出五萬貫獎賞，歸還馬燧的家財，不久，加任魏博招討使。田悅向淄青節度使李納、成德節度使李惟嶽求救，李納派大將衛俊率軍一萬名救援田悅，李惟嶽也派兵三千名來救援。田悅召集被打散的士兵兩萬多人，在洹水築堡壘，淄青軍隊駐紮在他的東邊，成德軍隊駐紮在他的西邊，互相呼應。
馬燧率各軍進軍駐紮在鄴縣，奏本請求增派河陽軍隊，唐德宗下詔命河陽節度使李芃率兵與他們會合。唐軍駐紮在漳河邊，田悅派將領王光進率兵守長橋，築城牆固守，唐軍不能過河。馬燧就在下遊將幾百輛軍車，用鐵鎖相連，橫斷河水，填上裝土的口袋擋住水，水略微變淺了，各軍都過了河。這時唐軍糧少，田悅堅守不出戰，想等唐軍糧盡。馬燧命各軍帶十天糧食，進駐倉口，和田悅隔洹水對峙。李抱真和李芃問道：“糧食少卻深入敵區，是為什麽？”馬燧說：“糧食少利於速戰，兵法說要善於調動敵人，不受敵人擺布。現田悅和淄青、恒州三支軍隊互相呼應，用意是不出戰，待我軍糧盡，如分兵攻他們左、右軍，軍隊少不一定能攻破，田悅還會來救援，這樣前後都受敵。兵法說進攻敵人必救處，敵人一定會出戰。我要讓各軍打敗會合的敵軍。”
馬燧於是造三座橋過洹水，每天挑戰，田悅不敢出戰。恒州軍因兵少，怕被馬燧殲滅，移軍與田悅會合。田悅認為馬燧明天還會挑戰，就埋伏一萬軍隊，想伏擊馬燧。馬燧就命各軍都半夜吃飯，雞叫前擊鼓吹號，悄悄出兵沿洹水直奔魏州，發令說：“聽到敵軍追來，就停下來列陣。”又命一百名騎兵擊鼓吹號，都留在後邊，又準備柴草火種，等軍隊都走了，停止擊鼓吹號躲在一邊，看到田悅軍都過了河，就把橋燒掉。唐軍走了十幾裏路，田悅就帶領淄青、恒州的步騎兵四萬多人過橋跟隨追來，順風放火，擊鼓呐喊前進。
馬燧就坐下，命令軍隊不要動，又派人除掉了百步見方地上的草和荊棘列陣，馬燧走出陣前，召募有勇力的五千多人，分別排在前邊，等待敵軍來。等田悅兵到，火已熄滅，而田悅所部也大為疲憊，馬燧趁勢出擊，大破田悅軍。神策、昭義、河陽軍都略退卻，河東軍戰勝後，各軍回軍合擊，又大敗敵軍，追到洹水邊，田悅軍逃到橋頭，橋已燒掉，田悅軍大亂，有的跳到水裏，被斬首兩萬多顆，斬其大將孫晉卿、安墨啜，活捉了三千多人，淹死的不計其數，淄青兵死亡殆盡，屍體相疊三十多裏地。
田悅召集敗兵一千多人逃往魏州，到了城門口，守將李長春關閉城門不接納。過了很久，追兵未來，到天亮，才接納田悅，田悅進了城，殺死了李長春，親自據城防守。幾天後，李再春以博州投降，田悅的哥哥田昂以洺州投降，王光進以長橋投降朝廷，田悅派符璘、李瑤帶五百名騎兵送淄青軍返回淄青，符璘、李瑤乘機前來投降馬燧。
魏州原來引禦河進城向南流，馬燧命堵塞河口，河水斷流，城中更恐慌了，田悅就派許士則、侯臧步行走小路勸說朱滔、王武俊，借兵援救。當時，王武俊已殺死李惟嶽，將頭送到京城，德宗任命王武俊為恒冀都團練觀察使，王武俊的同僚張孝忠已任義武節度使，王武俊僅任觀察使，又分割趙、深兩州為一鎮，任命康日知為觀察使，因此非常不滿，加上平日輕視張孝忠，對官職比他低感到羞恥。朱滔討伐李惟嶽，攻下了深州，要求將深州隸屬與幽州鎮而沒有被允許，也不滿，因此朱滔、王武俊合謀救援田悅。田悅倚仗兩處援兵，又派出兩萬軍隊背城列陣，馬燧和各軍又打敗了他。
朱滔、王武俊聯軍五萬來救援田悅，到了城外，諸將準備退兵，馬燧堅持不讓，德宗派朔方節度使李懷光率朔方軍步騎兵一萬五千人增援馬燧。李懷光所部也抵達，李懷光有勇無謀，大軍抵達當天，沒有休息，堅決要求與朱滔等會戰，唐軍戰敗。田悅等挖開河堤用水淹馬燧等人的軍隊，馬燧等兵敗糧少，馬燧和各軍退駐魏縣。德宗下詔加封馬燧為魏州大都督府長史，兼任魏博貝四州節度、觀察、招討等使。
田悅、朱滔、王武俊軍也到了魏縣，與唐軍隔河對峙，三位叛將在魏縣軍營中互相推讓王號：朱滔稱冀王，田悅稱魏王，王武俊稱趙王；又派使者去淄青李納那裏，李納稱齊王。四鎮一起推舉淮西節度使李希烈為天下兵馬元帥、太尉、建興王，都建署封官，像唐初行台官製，官名有很多怪異的，但不敢自立年號。五王相互勾結，意圖顛覆唐朝，黃河南北混亂，盜賊橫行；馬燧等雖然效忠唐朝，最終沒能平定叛亂。
涇原軍隊占據京城，德宗逃到奉天，馬燧率軍回到太原，有議論說：“馬燧如乘田悅洹水戰敗，合力進攻他，當時城中敗兵不到兩、三千人，都受傷躺倒，日夜等待投降；馬燧與李抱真不和，拖延不進攻叛軍，以至三位叛將勾結起來，至今仍是禍害，責任在馬燧。”馬燧到了太原，派行軍司馬王權率兵五千去奉天，又派兒子馬匯和大將的兒子與他們同去。在中渭橋紮營，等到德宗繼續逃往梁州後，王權、馬匯領兵回到太原。馬燧因晉陽是唐朝開創之地，考慮城東平曠易遭攻擊，當時國中動蕩，北麵邊境多次出現緊急情況，於是引晉水架槽流到城的東邊，蓄水成為護城河，叛軍來了可省去守城兵萬名，又引汾水繞城而流，多造池塘，種柳樹加固圍堤。不久又兼任保寧軍節度使。
馬燧升任檢校司徒，賜爵北平郡王，德宗回到京師，加封馬燧為奉誠軍及晉絳慈隰節度並管內諸軍行營副元帥，命他和侍中渾瑊、鎮國軍節度使駱元光一起去討伐河中。李懷光叛據河中，馬燧派人招降他，李懷光妹夫要廷珍據守晉州，衙將毛朝鰎據守隰州，鄭抗據守慈州，都相繼投降了馬燧。王武俊從魏縣回到封地，雖然放棄了王號，但仍舊圍攻趙州不止，康日知無法抵抗，想放棄趙州，馬燧奏本說：“可以下詔讓王武俊和李抱真一起進攻朱滔，將深州、趙州劃歸王武俊，請求改封康日知為晉慈隰節度使。”康日知還未到，三州都已投降了馬燧，因此又加封馬燧為晉慈隰節度使。馬燧就上表把三州讓給康日知，並說如因投降他就封給他，怕以後有功勞的人效仿作為慣例，德宗讚賞並答應了他，馬燧就派使者迎接康日知，等他到後，又清點倉庫交給他，康日知喜出望外。
馬燧率步騎三萬駐紮絳州，派兵收複了夏縣、攻占了稷山和龍門，李懷光的大將、任象玉投降。馬燧率兵攻絳州，這年十月，攻下了絳州外城，當天夜裏偽絳州刺史王克同和大將達奚小進馮萬興棄城逃跑，絳州軍隊四千人投降。他又派大將李自良、穀秀分頭收複聞喜、夏縣、萬泉、虞鄉、永樂、猗氏六縣，叛軍將領辛兟和五千士兵投降。穀秀因違犯軍令擄掠官吏女兒，馬燧將他斬首示眾。
軍隊抵達寶鼎，在陶城打敗了叛軍騎兵，先鋒官李黯追擊他們，射死敵將徐伯文，斬首萬餘級，得馬五百匹。這年，全國遭蝗災、旱災，物價飛漲，軍隊缺乏錢糧，因此很多京官上奏請求赦免李懷光，德宗沒有決定。馬燧因李懷光叛變罪行特別嚴重，河中靠近京城，反叛者不能信任，赦免他無法向全國交待，怕德宗被侍從迷惑，而且軍情注重保密。馬燧離開軍隊率幾百名騎兵到京城朝拜，召見時，馬燧說：“我雖無武才，得到一個月的糧草供應，就能討平河中。”唐德宗答應了。
馬燧因到京城朝拜，就和渾瑊、駱元光、韓遊瑰軍隊會合，抵達長春宮。李懷光將領徐廷光率兵六千守宮殿城牆，守備很周密，馬燧考慮長春宮不攻占，李懷光就會更加死心防守，進攻他耗時過多、死傷必然嚴重，就親自到城下喊徐廷光。徐廷光平日敬畏馬燧名聲，就在城上拜見，馬燧估計徐廷光心裏已經屈服，就慢慢對他說：“我從朝廷來，你可以麵朝西邊接受命令。”徐廷光又跪拜了，馬燧於是勸告他們說：“你們都是朔方軍將士，自從安祿山反叛以來，帶頭建立大功，三十多年，功勞最大，為什麽拋棄祖輩功勳，背叛皇上，走上誅滅全族的道路呢！你們聽從我，不但可以免除禍患，還能得到富貴。”叛軍都不做聲，馬燧又說：“你們如果認為我的話不是真心，現相距不到幾步遠，你們可以射殺我！”於是，掀開衣袍對著他們，徐廷光感動得拜伏流淚，士兵們也流了淚。
此前一天，叛軍的焦籬堡守將尉珪率兵兩千，在當地投降了馬燧，徐廷光東邊道路已斷絕，於是率兵出城投降，馬燧帶幾名騎兵直接進城，對他們毫不疑心，沒有人不敬畏佩服。士兵高喊道：“我們又能做大唐的子民了！”渾瑊從此佩服馬燧，私下對部將說：“我曾認為馬燧用兵和我差不多，但奇怪他能多次地打敗田悅；現看他用兵判斷，我比他差得遠！”馬燧移駐焦籬堡，叛軍太原堡守將吳冏棄城逃跑，部下都投降了。馬燧率諸軍渡過黃河，八萬兵馬，都在城下列陣。叛軍將領牛名俊殺死李懷光率城投降，叛軍守城士兵還有一萬六千人，馬燧將叛軍將領閻晏、孟寶、張清、吳冏等七人斬首示眾，將被李懷光脅迫而造反所俘虜的人都放了。
馬燧從到京城朝拜回軍營後，共二十七天就平定了河中，德宗下詔書褒獎，升任光祿大夫，兼任侍中，還封一個兒子為五品正員官。賜宴賞賜後，回到太原，這一次，德宗賜馬燧《宸扆》、《台衡》兩篇銘文。馬燧回到太原，把兩篇文章刻在起義堂西邊，德宗為此題字，榮寵他到了這程度。
吐蕃大將尚結讚攻占鹽、夏兩州，各派兵據守，尚結讚大軍駐紮在鳴沙，從冬天到春天，羊和馬多數死亡，糧草接濟不上。德宗派馬燧任綏、銀、麟、勝招討使，命他和華州節度使駱元光、邠寧節度使韓遊瑰和鳳翔府各鎮軍隊在河西會合討伐。馬燧出兵，抵達石州，尚結讚聽說後十分害怕，派使者講和，又約盟誓，德宗都不同意。尚結讚又派遣大將論頰熱送重禮講好話向馬燧求和，馬燧因此多次為其講情，徳宗堅決不答應。
馬燧率軍回到太原，和論頰熱同去朝見，馬燧極力說吐蕃的誠意可擔保，請求答應盟誓，德宗同意，馬燧入朝後，尚結讚急忙從鳴沙返回吐蕃。侍中渾瑊和吐蕃宰相尚結讚在平涼盟誓，遭吐蕃軍隊劫盟，倉皇隻身逃脫，被劫持將領官員六十多名，因為是馬燧的錯誤主張，他因此被罷去兵權，封馬燧為司徒，兼任舊職侍中、北平郡王，又賜女樂師，隻是上朝參拜。
馬燧和太尉李晟在延英殿被接見，德宗嘉獎他們的大功，都在淩煙閣上繪像，列於開國元勳之後。馬燧在延英殿被召見。此前，德宗因馬燧有足疾，不要他去朝拜，因馬燧初冬拜見，德宗特地允許不拜就座。
太尉李晟剛去世，德宗對馬燧說：“從前你和李晟一起來，現在隻見到你了，不免覺得難過。”德宗哽咽了好一陣，馬燧退出時，腳不舒服，倒在地上，德宗親自扶他起來，送到台階邊，馬燧叩頭哭著謝恩，他多次請求辭去侍中之職，德宗下詔不允。馬燧於長安安邑裏的私宅中病逝，享年七十歲，德宗為其輟朝四日，下詔命京兆尹韓皋監護喪事、嗣吳王李獻任吊祭贈賵使，追贈太尉，賜諡號“莊武”。
馬燧，祖先從扶風郡遷來汝州，祖父馬瑉，官至左玉鈐衛倉曹；父親馬季龍，曾中舉明兵法科，豪爽擅長兵法，官至嵐州刺史、幽州經略軍使。馬燧早年時，有次和幾個哥哥讀書，放下書歎氣說：“國家將有難了，英雄應立功於世，平定天下，怎能辛辛苦苦當儒生呢！”馬燧儀表風度傑出，身長六尺二寸，沉著勇敢多智謀，博覽各種書籍，尤其擅長兵法。
安史之亂爆發，派光祿卿賈循守範陽，馬燧勸賈循說：“安祿山背恩反叛，雖然攻陷了洛陽，定將被消滅。您為什麽不建稀世功勳呢？殺死他的將領向潤客、牛廷玠，抄他的老窩。安祿山向西不能打進關中，就會困在那裏被抓住，天下就可以平定了。”賈循雖讚同這話，但未乘機定計，事情泄露了，安祿山派韓朝陽來請賈循。韓朝陽到了範陽，和賈循談話，暗地埋伏武士用弓弦勒死了他，馬燧逃出跑到西山，隱士徐遇把他藏了起來。一個月後，馬燧從小路來到平原郡，平原郡失守後，他又逃到魏郡。
澤潞節度使李抱玉任命他為趙城縣尉，這時回紇大軍歸國，倚仗幫助收複洛陽的功勞，胡作非為，有時擄掠路過處的倉庫糧食，供應飯食稍不滿意，隨便殺人。李抱玉準備了供給品，下屬都不敢去送，馬燧自薦請求主持驛館事務，等回紇軍來了，就先給主帥送禮，和他約定紀律，回紇軍就授給馬燧令旗做標誌，命馬燧殺死違令者。馬燧用死刑犯人在身邊侍侯，稍不聽令，就殺死他們，回紇兵看了害怕，軍隊從這裏走過，沒有人敢侵害擄掠，李抱玉更加賞識他。
馬燧就勸李抱玉說：“近來和回紇人談話，我了解了他們的情況，現仆固懷恩倚功結黨，李懷仙、張忠誌、薛嵩、田承嗣分守各地，都是仆固懷恩的主意，他的兒子仆固瑒佻勇不義，依我看來，一定會侵占太原、西山叛亂，您應多做準備。”不久，仆固懷恩果然和太原都將李竭誠同謀，想奪取太原，主帥辛雲京察覺了這事，殺了李謁誠，守城自衛，仆固懷恩派他的兒子仆固瑒領兵包圍了太原。
當初，回紇軍北行歸國，派他們的將領安恪、石常庭領兵幾百名和招募投靠的幾千人守河陽，從洛陽搶來的珍寶，都存放在河陽。這時，仆固懷恩派薛嵩從相州、衛州送糧並切斷黃河渡口，李抱玉命馬燧到薛嵩處勸說，薛嵩就和仆固懷恩斷絕了關係聽從朝廷。朝廷於是任命馬燧為左武衛兵曹。
馬燧此後曆任太子通事舍人、著作郎、營田判官。不久後，又升任秘書少監、兼任殿中侍禦史，改任節度判官、承務郎，升任鄭州刺史，他勉勵督促農耕，統計戶數，每年收稅一次，人們都認為方便。馬燧改任懷州刺史，懷州遭遇兵荒之後，適逢當年發生夏旱，人們不能種莊稼，馬燧努力改善政務，將領官吏有父母的，馬燧就登門問候，安葬野地未埋的屍骨，減輕賦稅。到秋天，州內長出了野穀子，百姓多半靠這度災。
李抱玉移任駐守鳳翔，因汧陽有邊患，任命馬燧為隴州刺史、兼任禦史中丞。隴州西部有條路，寬兩百多步，上通高山，山和吐蕃相對，吐蕃每次入侵，都從這裏出來。馬燧巡視地形，壘石栽樹堵住這路，下麵修了兩處門，又修有望樓，八天就修成了。碰到李抱玉入朝，就和馬燧一同前往，很久以後，唐代宗聞知了馬燧的能幹，召見了他，封為商州刺史，兼任禦史中丞、防禦水陸運使。河陽三城兵變，趕走了節度使常休明，朝廷於是任命馬燧為檢校左散騎常侍、禦史大夫、河陽三城節度使。
汴州大將李靈耀反叛，占據州城，切斷漕運，求封節度使，代宗寬大為懷，任命李靈耀為汴州、宋州等八州節度留後。李靈耀不接受任命，於是暗地勾結魏博節度使田承嗣；田承嗣就派他侄子田悅率兵支援李靈耀，打敗了永平軍大將劉洽。代宗下詔馬燧和淮西節度使李忠臣會合討平李靈耀，李忠臣怕叛軍，焚燒營帳往西跑。馬燧勸他回軍，請求擔任先鋒，打敗了田悅，逼近汴州。李忠臣沿汴河南岸進軍，馬燧沿汴河北岸進軍，又在西梁固打敗了李靈耀的將領張清。
李靈耀選精兵八千，號稱“餓糧軍”，馬燧單獨率軍打敗了它，進抵浚儀。當時，河陽軍是諸軍中最強的。田承嗣於是又派田悅率兵兩萬援救李靈耀，打敗了永平軍將領杜如江，進犯曹州，又打敗李正己的遊軍，擊潰了劉洽、長孫全緒等人的軍隊，乘勝進到離汴州三十裏處，列陣前進。李忠臣會合宋州、淮南、浙西的軍隊，與田悅作戰不勝，向馬燧求救，馬燧帶四千兵出其不意擊敗了田悅，田悅單人匹馬逃走。李靈耀知道田悅戰敗後，第二天率一百名騎兵逃跑，汴州就投降了，馬燧把功勞讓給李忠臣。李忠臣生性暴躁，馬燧不想進汴州城，就帶兵到板橋紮營，李忠臣進城後，果然獨吞功勞，利用機會殺了宋州刺史李僧惠，馬燧於是回到了河陽。
馬燧任檢校工部尚書、太原尹、北都留守、河東節度留後，不久被任命為河東節度使，太原自前任節度使鮑防在百井戰敗後，軍隊弱小，馬燧就召集全部將領官吏的仆役，得到幾千人，都補充為騎兵，訓練了幾個月，成了精銳的騎兵。他命令製鎧甲一定按長短分三等，和士兵衣裳相當，以便行動，又製造軍車，蒙上畫有狻猊圖案的皮革，車後安有戟，行軍時裝運兵器鎧甲，宿營時列成營陣，有時堵在險要處阻擋敵軍進攻，軍械都十分犀利。過了一年，集中三萬軍隊，在校場上練習戰陣，教他們進退攻守的戰術。馬燧到京城朝見，升任檢校兵部尚書，朝廷命他回鎮太原。
魏博節度使田悅接替田承嗣帶兵，怕部將不歸附自己，假裝歸順，馬燧奏本揭露他一定會反叛，應先防備他。這年，田悅果然和淄青節度使李正己、成德節度使李惟嶽合謀反叛，親自率兵三萬包圍了邢州，自己到臨洺，築兩重城牆，隔絕內外，阻擋救兵。邢州守將李洪、臨洺守將張伾，都固守沒被攻破。昭義軍向朝廷求救，德宗急忙下詔命馬燧率步、騎兵兩萬人馬和昭義軍節度使李抱真、神策軍行營兵馬使李晟會合援救臨洺。馬燧軍從山郭口經過，軍隊沒通過險要地時，就派人送信告訴田悅，並表示友好，田悅認為馬燧畏懼自己。
馬燧率軍抵達邯鄲，田悅派使者來，馬燧將其斬殺，並派兵擊潰了田悅的一支部隊，射死魏博將領成炫之。田悅自己進攻臨洺，派大將楊朝光率兵萬名，在臨洺南邊雙岡東西並列兩個營寨抵禦馬燧。馬燧就率李抱真、李晟進軍，在兩座營寨之間紮營，這天夜裏東邊營寨兵馬逃回田悅處。第二天，馬燧進軍到明山紮營，占據被拋棄的營寨放置軍需品，田悅對部下說：“楊朝光堅守營寨的兵不少於一萬人，即使馬燧等用全部精兵攻他，幾天內，估計攻不下來。死傷一定很重。我這裏一定攻下了臨洺，犒勞兵將再和他們作戰，這是必贏的部署。”
田悅於是派恒州李惟嶽的援軍五千增援楊朝光，馬燧帶兵進攻楊朝光，田悅又帶一萬多軍隊增援他，馬燧就命大將李自良、李奉國率騎兵會同神策軍在雙岡抵禦，下令道：“讓田悅過來了，就殺了你們！”李自良等擊退了田悅。馬燧就命推出燃火車燒楊朝光的營寨，殺死了楊朝光和大將盧子昌，斬首五千餘級，活捉八百多人，停留五天，推進到臨洺，田悅率全軍來會戰。馬燧親自率領精兵抵擋前鋒，接戰一百多次，士兵都死戰，田悅軍大敗，斬首一萬餘級，活捉九百人，繳獲糧食三十萬斛，器械鎧甲與這相當。田悅召集敗兵夜裏逃走了，對邢州的包圍也解除了，因功勞升任右仆射。
戰前，馬燧對兵將起誓，戰勝後用私財行賞。戰勝後，馬燧拿出所有家財獎賞兵將，德宗稱讚他，下詔拿出五萬貫獎賞，歸還馬燧的家財，不久，加任魏博招討使。田悅向淄青節度使李納、成德節度使李惟嶽求救，李納派大將衛俊率軍一萬名救援田悅，李惟嶽也派兵三千名來救援。田悅召集被打散的士兵兩萬多人，在洹水築堡壘，淄青軍隊駐紮在他的東邊，成德軍隊駐紮在他的西邊，互相呼應。
馬燧率各軍進軍駐紮在鄴縣，奏本請求增派河陽軍隊，唐德宗下詔命河陽節度使李芃率兵與他們會合。唐軍駐紮在漳河邊，田悅派將領王光進率兵守長橋，築城牆固守，唐軍不能過河。馬燧就在下遊將幾百輛軍車，用鐵鎖相連，橫斷河水，填上裝土的口袋擋住水，水略微變淺了，各軍都過了河。這時唐軍糧少，田悅堅守不出戰，想等唐軍糧盡。馬燧命各軍帶十天糧食，進駐倉口，和田悅隔洹水對峙。李抱真和李芃問道：“糧食少卻深入敵區，是為什麽？”馬燧說：“糧食少利於速戰，兵法說要善於調動敵人，不受敵人擺布。現田悅和淄青、恒州三支軍隊互相呼應，用意是不出戰，待我軍糧盡，如分兵攻他們左、右軍，軍隊少不一定能攻破，田悅還會來救援，這樣前後都受敵。兵法說進攻敵人必救處，敵人一定會出戰。我要讓各軍打敗會合的敵軍。”
馬燧於是造三座橋過洹水，每天挑戰，田悅不敢出戰。恒州軍因兵少，怕被馬燧殲滅，移軍與田悅會合。田悅認為馬燧明天還會挑戰，就埋伏一萬軍隊，想伏擊馬燧。馬燧就命各軍都半夜吃飯，雞叫前擊鼓吹號，悄悄出兵沿洹水直奔魏州，發令說：“聽到敵軍追來，就停下來列陣。”又命一百名騎兵擊鼓吹號，都留在後邊，又準備柴草火種，等軍隊都走了，停止擊鼓吹號躲在一邊，看到田悅軍都過了河，就把橋燒掉。唐軍走了十幾裏路，田悅就帶領淄青、恒州的步騎兵四萬多人過橋跟隨追來，順風放火，擊鼓呐喊前進。
馬燧就坐下，命令軍隊不要動，又派人除掉了百步見方地上的草和荊棘列陣，馬燧走出陣前，召募有勇力的五千多人，分別排在前邊，等待敵軍來。等田悅兵到，火已熄滅，而田悅所部也大為疲憊，馬燧趁勢出擊，大破田悅軍。神策、昭義、河陽軍都略退卻，河東軍戰勝後，各軍回軍合擊，又大敗敵軍，追到洹水邊，田悅軍逃到橋頭，橋已燒掉，田悅軍大亂，有的跳到水裏，被斬首兩萬多顆，斬其大將孫晉卿、安墨啜，活捉了三千多人，淹死的不計其數，淄青兵死亡殆盡，屍體相疊三十多裏地。
田悅召集敗兵一千多人逃往魏州，到了城門口，守將李長春關閉城門不接納。過了很久，追兵未來，到天亮，才接納田悅，田悅進了城，殺死了李長春，親自據城防守。幾天後，李再春以博州投降，田悅的哥哥田昂以洺州投降，王光進以長橋投降朝廷，田悅派符璘、李瑤帶五百名騎兵送淄青軍返回淄青，符璘、李瑤乘機前來投降馬燧。
魏州原來引禦河進城向南流，馬燧命堵塞河口，河水斷流，城中更恐慌了，田悅就派許士則、侯臧步行走小路勸說朱滔、王武俊，借兵援救。當時，王武俊已殺死李惟嶽，將頭送到京城，德宗任命王武俊為恒冀都團練觀察使，王武俊的同僚張孝忠已任義武節度使，王武俊僅任觀察使，又分割趙、深兩州為一鎮，任命康日知為觀察使，因此非常不滿，加上平日輕視張孝忠，對官職比他低感到羞恥。朱滔討伐李惟嶽，攻下了深州，要求將深州隸屬與幽州鎮而沒有被允許，也不滿，因此朱滔、王武俊合謀救援田悅。田悅倚仗兩處援兵，又派出兩萬軍隊背城列陣，馬燧和各軍又打敗了他。
朱滔、王武俊聯軍五萬來救援田悅，到了城外，諸將準備退兵，馬燧堅持不讓，德宗派朔方節度使李懷光率朔方軍步騎兵一萬五千人增援馬燧。李懷光所部也抵達，李懷光有勇無謀，大軍抵達當天，沒有休息，堅決要求與朱滔等會戰，唐軍戰敗。田悅等挖開河堤用水淹馬燧等人的軍隊，馬燧等兵敗糧少，馬燧和各軍退駐魏縣。德宗下詔加封馬燧為魏州大都督府長史，兼任魏博貝四州節度、觀察、招討等使。
田悅、朱滔、王武俊軍也到了魏縣，與唐軍隔河對峙，三位叛將在魏縣軍營中互相推讓王號：朱滔稱冀王，田悅稱魏王，王武俊稱趙王；又派使者去淄青李納那裏，李納稱齊王。四鎮一起推舉淮西節度使李希烈為天下兵馬元帥、太尉、建興王，都建署封官，像唐初行台官製，官名有很多怪異的，但不敢自立年號。五王相互勾結，意圖顛覆唐朝，黃河南北混亂，盜賊橫行；馬燧等雖然效忠唐朝，最終沒能平定叛亂。
涇原軍隊占據京城，德宗逃到奉天，馬燧率軍回到太原，有議論說：“馬燧如乘田悅洹水戰敗，合力進攻他，當時城中敗兵不到兩、三千人，都受傷躺倒，日夜等待投降；馬燧與李抱真不和，拖延不進攻叛軍，以至三位叛將勾結起來，至今仍是禍害，責任在馬燧。”馬燧到了太原，派行軍司馬王權率兵五千去奉天，又派兒子馬匯和大將的兒子與他們同去。在中渭橋紮營，等到德宗繼續逃往梁州後，王權、馬匯領兵回到太原。馬燧因晉陽是唐朝開創之地，考慮城東平曠易遭攻擊，當時國中動蕩，北麵邊境多次出現緊急情況，於是引晉水架槽流到城的東邊，蓄水成為護城河，叛軍來了可省去守城兵萬名，又引汾水繞城而流，多造池塘，種柳樹加固圍堤。不久又兼任保寧軍節度使。
馬燧升任檢校司徒，賜爵北平郡王，德宗回到京師，加封馬燧為奉誠軍及晉絳慈隰節度並管內諸軍行營副元帥，命他和侍中渾瑊、鎮國軍節度使駱元光一起去討伐河中。李懷光叛據河中，馬燧派人招降他，李懷光妹夫要廷珍據守晉州，衙將毛朝鰎據守隰州，鄭抗據守慈州，都相繼投降了馬燧。王武俊從魏縣回到封地，雖然放棄了王號，但仍舊圍攻趙州不止，康日知無法抵抗，想放棄趙州，馬燧奏本說：“可以下詔讓王武俊和李抱真一起進攻朱滔，將深州、趙州劃歸王武俊，請求改封康日知為晉慈隰節度使。”康日知還未到，三州都已投降了馬燧，因此又加封馬燧為晉慈隰節度使。馬燧就上表把三州讓給康日知，並說如因投降他就封給他，怕以後有功勞的人效仿作為慣例，德宗讚賞並答應了他，馬燧就派使者迎接康日知，等他到後，又清點倉庫交給他，康日知喜出望外。
馬燧率步騎三萬駐紮絳州，派兵收複了夏縣、攻占了稷山和龍門，李懷光的大將、任象玉投降。馬燧率兵攻絳州，這年十月，攻下了絳州外城，當天夜裏偽絳州刺史王克同和大將達奚小進馮萬興棄城逃跑，絳州軍隊四千人投降。他又派大將李自良、穀秀分頭收複聞喜、夏縣、萬泉、虞鄉、永樂、猗氏六縣，叛軍將領辛兟和五千士兵投降。穀秀因違犯軍令擄掠官吏女兒，馬燧將他斬首示眾。
軍隊抵達寶鼎，在陶城打敗了叛軍騎兵，先鋒官李黯追擊他們，射死敵將徐伯文，斬首萬餘級，得馬五百匹。這年，全國遭蝗災、旱災，物價飛漲，軍隊缺乏錢糧，因此很多京官上奏請求赦免李懷光，德宗沒有決定。馬燧因李懷光叛變罪行特別嚴重，河中靠近京城，反叛者不能信任，赦免他無法向全國交待，怕德宗被侍從迷惑，而且軍情注重保密。馬燧離開軍隊率幾百名騎兵到京城朝拜，召見時，馬燧說：“我雖無武才，得到一個月的糧草供應，就能討平河中。”唐德宗答應了。
馬燧因到京城朝拜，就和渾瑊、駱元光、韓遊瑰軍隊會合，抵達長春宮。李懷光將領徐廷光率兵六千守宮殿城牆，守備很周密，馬燧考慮長春宮不攻占，李懷光就會更加死心防守，進攻他耗時過多、死傷必然嚴重，就親自到城下喊徐廷光。徐廷光平日敬畏馬燧名聲，就在城上拜見，馬燧估計徐廷光心裏已經屈服，就慢慢對他說：“我從朝廷來，你可以麵朝西邊接受命令。”徐廷光又跪拜了，馬燧於是勸告他們說：“你們都是朔方軍將士，自從安祿山反叛以來，帶頭建立大功，三十多年，功勞最大，為什麽拋棄祖輩功勳，背叛皇上，走上誅滅全族的道路呢！你們聽從我，不但可以免除禍患，還能得到富貴。”叛軍都不做聲，馬燧又說：“你們如果認為我的話不是真心，現相距不到幾步遠，你們可以射殺我！”於是，掀開衣袍對著他們，徐廷光感動得拜伏流淚，士兵們也流了淚。
此前一天，叛軍的焦籬堡守將尉珪率兵兩千，在當地投降了馬燧，徐廷光東邊道路已斷絕，於是率兵出城投降，馬燧帶幾名騎兵直接進城，對他們毫不疑心，沒有人不敬畏佩服。士兵高喊道：“我們又能做大唐的子民了！”渾瑊從此佩服馬燧，私下對部將說：“我曾認為馬燧用兵和我差不多，但奇怪他能多次地打敗田悅；現看他用兵判斷，我比他差得遠！”馬燧移駐焦籬堡，叛軍太原堡守將吳冏棄城逃跑，部下都投降了。馬燧率諸軍渡過黃河，八萬兵馬，都在城下列陣。叛軍將領牛名俊殺死李懷光率城投降，叛軍守城士兵還有一萬六千人，馬燧將叛軍將領閻晏、孟寶、張清、吳冏等七人斬首示眾，將被李懷光脅迫而造反所俘虜的人都放了。
馬燧從到京城朝拜回軍營後，共二十七天就平定了河中，德宗下詔書褒獎，升任光祿大夫，兼任侍中，還封一個兒子為五品正員官。賜宴賞賜後，回到太原，這一次，德宗賜馬燧《宸扆》、《台衡》兩篇銘文。馬燧回到太原，把兩篇文章刻在起義堂西邊，德宗為此題字，榮寵他到了這程度。
吐蕃大將尚結讚攻占鹽、夏兩州，各派兵據守，尚結讚大軍駐紮在鳴沙，從冬天到春天，羊和馬多數死亡，糧草接濟不上。德宗派馬燧任綏、銀、麟、勝招討使，命他和華州節度使駱元光、邠寧節度使韓遊瑰和鳳翔府各鎮軍隊在河西會合討伐。馬燧出兵，抵達石州，尚結讚聽說後十分害怕，派使者講和，又約盟誓，德宗都不同意。尚結讚又派遣大將論頰熱送重禮講好話向馬燧求和，馬燧因此多次為其講情，徳宗堅決不答應。
馬燧率軍回到太原，和論頰熱同去朝見，馬燧極力說吐蕃的誠意可擔保，請求答應盟誓，德宗同意，馬燧入朝後，尚結讚急忙從鳴沙返回吐蕃。侍中渾瑊和吐蕃宰相尚結讚在平涼盟誓，遭吐蕃軍隊劫盟，倉皇隻身逃脫，被劫持將領官員六十多名，因為是馬燧的錯誤主張，他因此被罷去兵權，封馬燧為司徒，兼任舊職侍中、北平郡王，又賜女樂師，隻是上朝參拜。
馬燧和太尉李晟在延英殿被接見，德宗嘉獎他們的大功，都在淩煙閣上繪像，列於開國元勳之後。馬燧在延英殿被召見。此前，德宗因馬燧有足疾，不要他去朝拜，因馬燧初冬拜見，德宗特地允許不拜就座。
太尉李晟剛去世，德宗對馬燧說：“從前你和李晟一起來，現在隻見到你了，不免覺得難過。”德宗哽咽了好一陣，馬燧退出時，腳不舒服，倒在地上，德宗親自扶他起來，送到台階邊，馬燧叩頭哭著謝恩，他多次請求辭去侍中之職，德宗下詔不允。馬燧於長安安邑裏的私宅中病逝，享年七十歲，德宗為其輟朝四日，下詔命京兆尹韓皋監護喪事、嗣吳王李獻任吊祭贈賵使，追贈太尉，賜諡號“莊武”。