“好的,沒問題,str估計不會有的,因為這段dna是外顯子,一般不會有str,snp肯定會有的,我馬上去確認。話說ncbi你怎麽能不會用,這可是學生物信息學的基礎,你要盡快掌握哈,過兩天不忙了我去教你,包教包會…”
電話那頭滔滔不絕的熱情,讓喬飛莞爾。
……
用那段dna確定是否和蔣慕軒有關,必須知道這段序列上,有多少snp位點或者str信息。
因為人與人的dna序列,有999都是相同的,必須測定那些人與人之間不同的核苷酸位點,才能說明問題,這也是親緣關係鑒定的技術原理。
喬飛問梁曉慧這段序列上的snp與str變異,就是為了找到這段序列上的不同,如果這些人與人之間不同的點,和蔣慕軒卻相同,就能夠證明了。
snp,單核苷酸多態性,簡單來說,指的是經常出現的單個dna位點的變異,這和單點基因突變隻有不到1人群概率不同,這種變異廣泛存在。
比如發現某個基因位點,有70的人是tt型,有19是ct型,有11是型,這三種類型的人,出生的時候,沒有明顯的個體差異。
如果這個基因位點有99以上的人都是同一類型,隻有不到1的人不一樣,這屬於基因突變而不是snp變異,基因突變一般情況下,是會引起嚴重的疾病的。
從喬飛出生的2002年左右開始,世界範圍內開始了針對snp變異的廣泛研究,發現了這一類的變異,雖然不會直接導致個體的差異,卻會讓人產生一些不同——患上某種疾病概率的不同。
就像上麵的基因型,大部分人是tt型的,結果經過統計發現,ct型的人,比tt型的人,更容易患上糖尿病…
所以大概2008年左右,整個世界範圍內,出現了大量針對snp位點進行測序服務的公司,通過檢測snp變異,告訴受檢者容易患上哪種疾病,提前預防…市場火熱了十多年——京西商城上麵的那些基因檢測產品,都是此類。
而str,是dna的短串重複序列,是指的dna序列上某些固定序列的重複,重複的數量,人與人之間也經常不同。
如5’—atcggagagagagagactagta—3’這段序列,str指的就是其中的ga,重複了六次,而有些人是七次,有些人是五次,一般情況下,也不會引起個體太大的差異。
但是無論snp還是str,都可以作為喬飛鑒定的依據。
再次思考了一次自己的邏輯,喬飛覺得沒有任何問題,果斷的將自己具有27kb基因序列的全基因組數據,和蔣慕軒的基因數據,一起上傳到梁曉慧做的程序中。
如果係統能夠直接分析基因序列,就太好了,喬飛喃喃自語。
不過現在不用著急,係統以後會升級的,也許真的就會有這個功能也說不定,喬飛感覺對自己的係統,還是充滿希望的,即使到現在也沒搞清楚它升級的經驗,到底是什麽鬼。
喬飛直接從梁曉慧的程序裏麵進行設置,隻比對那27kb的dna序列——因為其他的dna片段根本沒有任何必要。
因為數據少,綠色的進度條幾乎一秒鍾,就跑到了盡頭。
而顯示的結果,則是——完全相同!
自己那缺失的27kbdna片段,那段莫名其妙回到自己細胞中的dna片段,果然和蔣慕軒的——一模一樣!
喬飛十指交叉,頂著自己的下巴,等待梁曉慧查詢的結果,因為還不確定這段dna上是否有snp,如果沒有,那說明不了任何問題——因為如果沒有的話,這段dna序列,所有人類都是一樣的。
理論上,平均每1000個dna堿基對,差不多會有一個snp位點,隻是這段樣本序列太短了,隻有27kb,按照概率算,隻有不到3個——位點太少的話,同樣說明不了什麽問題,因為,會有大量的人群重合。
喬飛就這樣平靜的等待,內心深處卻有一絲複雜的感覺,既希望這段dna序列中,snp變異位點能夠紮堆,能夠直接證明這段dna序列,的確來自蔣慕軒,又擔心證明這個結論後,該如何麵對這個結論——實錘了自己身體,和蔣慕軒的關係。
隨著電話響起,喬飛接了起來,淡淡的問道:“已經查好了?”
“必須啊,你好好學哈,我發到你啟明局係統了…你現在看看,我等你。”喬飛聽到對方把手機放在了桌子上,發出一聲清脆的碰撞。
打開啟明局的通訊係統,果然發現了梁曉慧的郵件:
str變異,沒有,果然沒有。
snp位點,共計四個…
這個數量,有點差強人意,喬飛繼續往下看:
四個snp分別是rs87394aa45ag40gg15
rs87402at…
…
…
居然連基因頻率也幫忙查到了,通過計算,喬飛馬上得出了結論,這段27kb的dna序列,和蔣慕軒相同的概率是832。
832,似乎,會有巧合的情況存在啊,喬飛喃喃自語,對這個數值很不滿意。
因為snp數量太少,導致和蔣慕軒這段基因相同的概率太大,有832的人,會完全和蔣慕軒的這段基因一樣,還是無法確定,自己的這段dna序列,是否在832的人群之中。
“喂,你看到了沒?”電話那頭傳來有些焦急的聲音,似乎是等喬飛等的太久了。
喬飛思考了一下,說道:“梁老師,我發給你一段27kb的dna序列,您幫忙上麵有沒有突變。”
“老師”這兩個字非常的受用,喬飛感覺電話的另一頭熱情急劇上升,連說沒問題。
果然,情商高好辦事,喬飛笑了笑,將蔣慕軒的那段27kb的dna序列,直接發送了過去。
snp無法證明這段序列是蔣慕軒獨有,隻有做最後的嚐試——蔣慕軒的dna上有突變,如果有突變,就可以直接確定了。
隻是會有突變的概率會很低——因為一般基因突變的人會有嚴重的先天疾病,就像自己的白化病,而蔣慕軒明顯是健康的。
即使沒報什麽希望,喬飛還是決定嚐試,可能是想起了秦蘭的工作態度,大膽假設,小心求證。
不到三分鍾,梁曉慧回複——查到了。
喬飛又一次撥通了梁曉慧的電話,還沒等說什麽,梁曉慧已經迫不及待的告訴他:“你手真快,我正要給你打過去的…你發我的這段dna上,有兩個點突變,是沉默突變!”
“頻率呢?”喬飛問道。
“等我算算,額都很低,一個004,另一個06”
……
電話那頭滔滔不絕的熱情,讓喬飛莞爾。
……
用那段dna確定是否和蔣慕軒有關,必須知道這段序列上,有多少snp位點或者str信息。
因為人與人的dna序列,有999都是相同的,必須測定那些人與人之間不同的核苷酸位點,才能說明問題,這也是親緣關係鑒定的技術原理。
喬飛問梁曉慧這段序列上的snp與str變異,就是為了找到這段序列上的不同,如果這些人與人之間不同的點,和蔣慕軒卻相同,就能夠證明了。
snp,單核苷酸多態性,簡單來說,指的是經常出現的單個dna位點的變異,這和單點基因突變隻有不到1人群概率不同,這種變異廣泛存在。
比如發現某個基因位點,有70的人是tt型,有19是ct型,有11是型,這三種類型的人,出生的時候,沒有明顯的個體差異。
如果這個基因位點有99以上的人都是同一類型,隻有不到1的人不一樣,這屬於基因突變而不是snp變異,基因突變一般情況下,是會引起嚴重的疾病的。
從喬飛出生的2002年左右開始,世界範圍內開始了針對snp變異的廣泛研究,發現了這一類的變異,雖然不會直接導致個體的差異,卻會讓人產生一些不同——患上某種疾病概率的不同。
就像上麵的基因型,大部分人是tt型的,結果經過統計發現,ct型的人,比tt型的人,更容易患上糖尿病…
所以大概2008年左右,整個世界範圍內,出現了大量針對snp位點進行測序服務的公司,通過檢測snp變異,告訴受檢者容易患上哪種疾病,提前預防…市場火熱了十多年——京西商城上麵的那些基因檢測產品,都是此類。
而str,是dna的短串重複序列,是指的dna序列上某些固定序列的重複,重複的數量,人與人之間也經常不同。
如5’—atcggagagagagagactagta—3’這段序列,str指的就是其中的ga,重複了六次,而有些人是七次,有些人是五次,一般情況下,也不會引起個體太大的差異。
但是無論snp還是str,都可以作為喬飛鑒定的依據。
再次思考了一次自己的邏輯,喬飛覺得沒有任何問題,果斷的將自己具有27kb基因序列的全基因組數據,和蔣慕軒的基因數據,一起上傳到梁曉慧做的程序中。
如果係統能夠直接分析基因序列,就太好了,喬飛喃喃自語。
不過現在不用著急,係統以後會升級的,也許真的就會有這個功能也說不定,喬飛感覺對自己的係統,還是充滿希望的,即使到現在也沒搞清楚它升級的經驗,到底是什麽鬼。
喬飛直接從梁曉慧的程序裏麵進行設置,隻比對那27kb的dna序列——因為其他的dna片段根本沒有任何必要。
因為數據少,綠色的進度條幾乎一秒鍾,就跑到了盡頭。
而顯示的結果,則是——完全相同!
自己那缺失的27kbdna片段,那段莫名其妙回到自己細胞中的dna片段,果然和蔣慕軒的——一模一樣!
喬飛十指交叉,頂著自己的下巴,等待梁曉慧查詢的結果,因為還不確定這段dna上是否有snp,如果沒有,那說明不了任何問題——因為如果沒有的話,這段dna序列,所有人類都是一樣的。
理論上,平均每1000個dna堿基對,差不多會有一個snp位點,隻是這段樣本序列太短了,隻有27kb,按照概率算,隻有不到3個——位點太少的話,同樣說明不了什麽問題,因為,會有大量的人群重合。
喬飛就這樣平靜的等待,內心深處卻有一絲複雜的感覺,既希望這段dna序列中,snp變異位點能夠紮堆,能夠直接證明這段dna序列,的確來自蔣慕軒,又擔心證明這個結論後,該如何麵對這個結論——實錘了自己身體,和蔣慕軒的關係。
隨著電話響起,喬飛接了起來,淡淡的問道:“已經查好了?”
“必須啊,你好好學哈,我發到你啟明局係統了…你現在看看,我等你。”喬飛聽到對方把手機放在了桌子上,發出一聲清脆的碰撞。
打開啟明局的通訊係統,果然發現了梁曉慧的郵件:
str變異,沒有,果然沒有。
snp位點,共計四個…
這個數量,有點差強人意,喬飛繼續往下看:
四個snp分別是rs87394aa45ag40gg15
rs87402at…
…
…
居然連基因頻率也幫忙查到了,通過計算,喬飛馬上得出了結論,這段27kb的dna序列,和蔣慕軒相同的概率是832。
832,似乎,會有巧合的情況存在啊,喬飛喃喃自語,對這個數值很不滿意。
因為snp數量太少,導致和蔣慕軒這段基因相同的概率太大,有832的人,會完全和蔣慕軒的這段基因一樣,還是無法確定,自己的這段dna序列,是否在832的人群之中。
“喂,你看到了沒?”電話那頭傳來有些焦急的聲音,似乎是等喬飛等的太久了。
喬飛思考了一下,說道:“梁老師,我發給你一段27kb的dna序列,您幫忙上麵有沒有突變。”
“老師”這兩個字非常的受用,喬飛感覺電話的另一頭熱情急劇上升,連說沒問題。
果然,情商高好辦事,喬飛笑了笑,將蔣慕軒的那段27kb的dna序列,直接發送了過去。
snp無法證明這段序列是蔣慕軒獨有,隻有做最後的嚐試——蔣慕軒的dna上有突變,如果有突變,就可以直接確定了。
隻是會有突變的概率會很低——因為一般基因突變的人會有嚴重的先天疾病,就像自己的白化病,而蔣慕軒明顯是健康的。
即使沒報什麽希望,喬飛還是決定嚐試,可能是想起了秦蘭的工作態度,大膽假設,小心求證。
不到三分鍾,梁曉慧回複——查到了。
喬飛又一次撥通了梁曉慧的電話,還沒等說什麽,梁曉慧已經迫不及待的告訴他:“你手真快,我正要給你打過去的…你發我的這段dna上,有兩個點突變,是沉默突變!”
“頻率呢?”喬飛問道。
“等我算算,額都很低,一個004,另一個06”
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